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NCBI: 06-JUL-2013

Summary[edit | edit source]

  • organism: Staphylococcus aureus Newman
  • locus tag: NWMN_1345 [new locus tag: NWMN_RS07590 ]
  • pan locus tag?: SAUPAN003878000
  • symbol: ebh1
  • pan gene symbol?: ebh
  • synonym:
  • product: hypothetical protein

Genome View[edit | edit source]

Gene[edit | edit source]

General[edit | edit source]

  • type: CDS
  • locus tag: NWMN_1345 [new locus tag: NWMN_RS07590 ]
  • symbol: ebh1
  • product: hypothetical protein
  • replicon: chromosome
  • strand: -
  • coordinates: 1486448..1507543
  • length: 21096
  • essential: unknown other strains

Accession numbers[edit | edit source]

Phenotype[edit | edit source]

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DNA sequence[edit | edit source]

  • 1
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    GAGAATCGAGAATCTCAAGTACAAAATTCTCAAAATTCACAAAATGGTCAATCATTATCT
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    AATGCAGATTCTGGCACATTTAACTATGTAAAAGGCATTTTTGATAAGATTAATACGTTA
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    GGTACATATATCAATGCTTCTAGTAAAGGGGCGCCATATAATTTACCAACTACACCATGG
    AATACATTGAAGGCCTCTGACTCAAAGGAAATTGCTCTTATGACAGCGAAACAAACTGGA
    GACGGGTACCAATGGGTTATTAAGTTTAATAAAGGACATGCTCCACATCAAAATATGATC
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    AATTCAGATGGAACAAATGTACAATGGAGTCATGGAGCAGGAGCAGGTGCAAATAAACCA
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    TTTGGTAGACAAAATTTTGAATATATTAATGGTCAAAAACCTGCTGAATCACCGGGTGTT
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    CAAGGTCCAACTGTTAATAAATTGTACTATGCAGCAGGTGGGCGTGCTTTAGAGTACAAT
    CAATTATTTATGTACAGTCAACTATACGTCGAATCAACGCAAGACCATCAACAACGTCTT
    AATGGTTTAAGACAAGTGGTTAATCGTACATATCGCATAGGTACAACTAAACGTGTAGAA
    GTGAGTCAAGGAAATGTACAAACGAAAAAGGTATTAGAAAGTACAAACCTAAATATAGAT
    GATTTTGTTGATGATCCTTTAAGTTATGTTAAGACGCCGAGTAATAAAGTGTTAGGATTT
    TATTCGAATAATGCAAATACTAATGCTTTTAGACCGGGTGGAGCCCAACAATTAAATGAA
    TATCAATTAAGTCAATTATTTACTGATCAAAAATTACAAGAAGCAGCAAGAACTAGAAAC
    CCAATAAGATTAATGATTGGTTTCGACTATCCTGATGCTTATGGTAATAGTGAAACTTTA
    GTTCCTGTTAACTTAACGGTATTACCTGAAATCCAACATAATATTAAATTCTTTAAAAAT
    GACGATACTCAAAATATTGCTGAAAAACCATTTTCAAAACAAGCTGGGCATCCAGTTTTC
    TATGTATATGCAGGTAACCAAGGGAATGCTTCCGTGAATTTAGGTGGTAGCGTAACATCT
    ATTCAACCATTACGTATTAATTTAACAAGTAATGAGAATTTTACAGATAAAGATTGGCAA
    ATTACAGGTATTCCGCGTACATTACACATTGAAAACTCGACAAATAGACCTAATAATGCC
    AGAGAACGCAATATTGAACTTGTTGGTAACTTATTACCAGGGGATTACTTTGGAACGATA
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    ACAACGACAGCTGAGCAATTAAGAGGTACAGCATTACAAAAAGTGCCTGTTAATATTTCG
    GGAATACCGTTGGATCCATCGGCATTGGTTTATTTAGTTGCACCAACAAATCAAACTACG
    AATGGTGGTAGTGAGGCAGATCAAATACCATCTGGTTATACGATACTTGCGACTGGTACA
    CCTGATGGGGTGCATAATACAATTACTATACGACCGCAAGATTATGTTGTATTCATACCA
    CCTGTAGGTAAACAAATTAGAGCAGTAGTTTATTATAATAAAGTAGTTGCATCTAATATG
    AGTAATGCTGTTACTATTTTGCCAGATGACATTCCACCAACAATCAATAATCCTGTTGGA
    ATAAATGCCAAATACTATCGAGGCGACGAAGTCAACTTTACAATGGGTGTCTCTGATAGA
    CATTCTGGTATAAAAAATACAACTATTACGACATTGCCGAATGGTTGGACATCAAATTTA
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    AATGATAGTCAATCTAAACATGTTTCAATTCATGTAGGTAAAATTAGTGAAGATGCTCAT
    CCGATTGTATTAGGAAATACTGAGAAAGTTGTAGTAGTCAATCCGACTGCTGTATCTAAT
    GATGAAAAGCAAAGCATAATTACTGCCTTTATGAATAAAAACCAAAATATAAGAGGATAT
    TTAGCATCAACTGATCCAGTAACTGTCGATAATAATGGTAATGTCACATTACATTACCGT
    GATGGCTCATCGACAACGCTTGATGCTACAAATGTGATGACATACGAACCAGTTGTGAAA
    CCTGAATACCAAACTGTCAATGCTGCTAAAACAGCAACGGTAACGATTGCTAAAGGACAA
    TCATTTAGTATTGGTGATATTAAACAATATTTTACTTTAAGTAATGGACAACCTATTCCA
    AGTGGCACATTTACAAATATTACATCTGATAGAACTATTCCAACTGCACAAGAAGTTAGT
    CAAATGAACGCAGGCACGCAGTTATACCATATAACTGCTACAAATGCGTATCATAAAGAT
    AGTGAAGACTTCTATATTAGTTTGAAAATCATCGATGTGAAACAACCAGAAGGCGATCAA
    CGTGTATATCGTACATCAACATATGATTTAACTACTGATGAAATCTCAAAAGTAAAACAA
    GCATTTATTAATGCAAATAGAGATGTAATTACGCTTGCCGAAGGTGATATTTCAGTTACA
    AATACACCTAATGGTGCTAATGTAAGTACTATTACAGTAAATATTAATAAAGGTCGATTA
    ACGAAATCATTCGCGTCAAACCTAGCTAATATGAATTTCTTGCGTTGGGTTAATTTCCCA
    CAAGATTATACAGTGACATGGACGAATGCAAAAATTGCAAACAGACCAACAGATGGTGGT
    TTATCATGGTCTGATGACCATAAATCTTTAATTTATCGTTATGATGCTACATTAGGTACT
    CAAATTACGACGAATGATATTTTAACAATGTTAAAAGCAACAACTACAGTGCCTGGATTG
    CGAAATAACATTACTGGTAATGAAAAATCACAAGCAGAAGCTGGCGGAAGACCTAACTTT
    AGAACGACTGGTTATTCACAATCAAATGCGACAACTGATGGTCAACGTCAATTTACGTTG
    AATGGTCAAGTGATTCAAGTGTTAGACATCATCAACCCTTCAAACGGTTATGGTGGGCAA
    CCTGTTACAAATTCAAATACTCGTGCAAACCATAGTAACTCAACTGTTGTTAACGTAAAC
    GAACCGGCAGCTAATGGTGCTGGCGCATTTACAATTGACCACGTTGTAAAAAGTAATTCT
    ACACATAATGCAAGTGATGCAGTTTATAAAGCACAGTTATACTTAACGCCATATGGTCCA
    AAACAATATGTTGAACATTTAAATCAAAATACAGGAAATACTACTGACGCTATTAACATT
    TATTTTGTACCAAGTGACTTAGTGAATCCAACAATTTCAGTAGGTAATTACACTAATCAT
    CAAGTGTTCTCAGGTGAAACATTTACAAATACTATTACAGCGAATGATAACTTTGGTGTG
    CAATCTGTAACTGTACCAAATACATCACAAATTACAGGTACTGTTGATAATAACCATCAA
    CATGTTTCTGCAACGGCACCAAATGTGACATCAGCAACTAATAAGACAATCAATTTATTA
    GCAACTGATACAAGCGGCAATACAGCTACAACTTCGTTCAATGTAACAGTGAAACCTTTG
    CGTGATAAATATCGAGTTGGTACTTCATCAACGGCTGCTAATCCTGTGAGAATTGCCAAT
    ATTTCGAATAATGCGACAGTATCACAAGCTGATCAAACGACAATTATTAATTCGTTAACG
    TTTACTGAAACAGTACCAAATAGAAGTTATGCAAGAGCAAGTGCGAATGAAATCACTAGT
    AAAACAGTTAGTAATGTCAGTCGTACTGGAAATAATGCCAATGTCACAGTAACTGTTACT
    TATCAAGATGGAACAACATCAACAGTGACTGTACCTGTAAAGCATGTCATTCCAGAAATC
    GTTGCACATTCGCATTACACTGTACAAGGCCAAGACTTCCCAGCAGGTAATGGTTCTAGT
    GCATCAGATTACTTTAAGTTATCTAATGGTAGTGACATTGCAGATGCAACTATTACATGG
    GTAAGTGGACAAGCGCCAAATAAAGATAATACACGTATTGGTGAAGATATAACTGTAACT
    GCACATATCTTAATTGATGGCGAAACAACGCCGATTACGAAAACAGCAACATATAAAGTA
    GTAAGAACTGTACCGAAACATGTCTTTGAAACAGCCAGAGGTGTTTTATACCCAGGTGTT
    TCAGATATGTATGATGCGAAACAATATGTTAAGCCAGTAAATAATTCTTGGTCGACAAAT
    GCGCAACATATGAATTTCCAATTTGTTGGAACATATGGTCCTAACAAAGATGTTGTAGGC
    ATATCTACTCGTCTTATTAGAGTGACATATGATAATAGACAAACAGAAGATTTAACTATT
    TTATCTAAAGTTAAACCTGACCCACCTAGAATTGACGCAAACTCTGTGACATATAAAGCA
    GGTCTTACAAACCAAGAAATTAAAGTTAATAACGTATTAAATAACTCGTCAGTAAAATTA
    TTTAAAGCAGATAATACACCATTAAATGTCACAAATATTACTCATGGTAGCGGTTTTAGT
    TCGGTTGTGACAGTAAGTGACGCGTTACCAAATGGCGGAATTAAAGCAAAATCTTCAATT
    TCAATGAACAATGTGACGTATACGACGCAAGACGAACATGGTCAAGTTGTTACAGTAACA
    AGAAATGAATCTGTTGATTCAAATGACAGTGCAACAGTAACAGTGACACCACAATTACAA
    GCAACTACTGAAGGCGCTGTATTTATTAAAGGTGGCGACGGTTTTGATTTCGGACACGTA
    GAAAGATTTATTCAAAACCCGCCACATGGGGCAACGGTTGCATGGCATGATAGTCCAGAT
    ACATGGAAGAATACAGTCGGTAACACTCATAAAACTGCGGTTGTAACATTACCTAATGGT
    CAAGGTACGCGTAATGTTGAAGTTCCAGTCAAAGTTTATCCAGTTGCTAATGCAAAGGCG
    CCATCACGTGATGTGAAAGGTCAAAATTTGACTAATGGAACGGATGCGATGAACTACATT
    ACATTTGATCCAAATACAAACACAAATGGTATCACTGCAGCATGGGCAAATAGACAACAA
    CCAAATAACCAACAAGCAGGCGTGCAACATTTAAATGTCGATGTCACATATCCAGGTATT
    TCAGCTGCTAAACGAGTTCCTGTTACTGTTAATGTATATCAATTTGAATTCCCTCAAACT
    ACTTATACGACAACGGTTGGAGGCACTTTAGCAAGTGGTACGCAAGCATCAGGATATGCA
    CATATGCAAAATGCTACTGGTTTACCAACAGATGGATTTACGTATAAATGGAATCGTGAT
    ACTACAGGTACAAATGACGCAAACTGGTCAGCTATGAATAAACCGAATGTGGCTAAAGTC
    GTTAACGCAAAATATGACGTCATCTATAACGGACATACTTTTGCAACATCTTTACCAGCG
    AAATTTGTAGTAAAAGATGTGCAACCAGCGAAACCAACTGTGACTGAAACAGCGGCAGGA
    GCGATTACAATTGCACCTGGAGCAAACCAAACAGTGAATACACATGCCGGTAACGTAACG
    ACATACGCTGATAAATTAGTTATTAAACGTAATGGTAACGTTGTGACGACATTTACACGT
    CGCAATAATACGAGTCCATGGGTGAAAGAAGCATCTGCAGCAACTGTAGCAGGTATTGCT
    GGAACTAATAATGGTATTACTGTTGCAGCAGGTACTTTCAACCCTGCTGATACAATTCAA
    GTTGTTGCAACGCAAGGAAGCGGAGAGACAGTGAGTGATGAGCAACGTAGTGATGATTTC
    ACAGTTGTCGCACCACAACCGAACCAAGCGACTACTAAGATTTGGCAAAATGGTCATATT
    GATATCACGCCTAATAATCCATCAGGACATTTAATTAATCCAACTCAAGCAATGGATATT
    GCTTACACTGAAAAAGTGGGTAATGGTGCAGAACATAGTAAGACAATTAATGTTGTTCGT
    GGTCAAAATAATCAATGGACAATTGCGAATAAGCCTGACTATGTAACGTTAGATGCACAA
    ACTGGTAAAGTGACGTTCAATGCCAATACTATAAAACCAAATTCATCAATCACAATTACT
    CCGAAAGCAGGTACAGGTCACTCAGTAAGTAGTAATCCAAGTACATTAACTGCACCGGCA
    GCTCATACTGTCAACACAACTGAAATTGTGAAAGATTATGGTTCAAATGTAACAGCAGCT
    GAAATTAACAATGCAGTTCAAGTTGCTAATAAACGTACTGCAACGATTAAAAATGGCACA
    GCAATGCCTACTAATTTAGCTGGTGGTAGCACAACGACGATTCCTGTGACAGTAACTTAC
    AATGATGGTAGTACTGAAGAAGTACAAGAGTCCATTTTCACAAAAGCGGATAAACGTGAG
    TTAATCACAGCTAAAAATCATTTAGATGATCCAGTAAGCACTGAAGGTAAAAAGCCAGGT
    ACAATTACGCAGTACAATAATGCAATGCATAATGCGCAACAACAAATCAATACTGCGAAA
    ACAGAAGCACAACAAGTGATTAATAATGAGCGTGCAACACCACAACAAGTTTCTGACGCA
    CTAACTAAAGTTCGTGCAGCACAAACTAAGATTGATCAAGCTAAAGCATTACTTCAAAAT
    AAAGAAGATAATAGCCAATTAGTAACGTCTAAAAATAACTTACAAAGTTCTGTGAACCAA
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    GAAGCAGAAACTGAAATAACTGCAGCTCAACGTGTTATTGACAATGGCGATGCAACTGCA
    CAACAAATTTCAGATGAAAAACATCGTGTCGATAACGCATTAACAGCATTAAACCAAGCG
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    20880
    20940
    21000
    21060
    21096

Protein[edit | edit source]

General[edit | edit source]

  • locus tag: NWMN_1345 [new locus tag: NWMN_RS07590 ]
  • symbol: Ebh1
  • description: hypothetical protein
  • length: 7031
  • theoretical pI: 7.74354
  • theoretical MW: 752575
  • GRAVY: -0.696231

Function[edit | edit source]

  • TIGRFAM:
    hyperosmolarity resistance protein Ebh (TIGR04264; HMM-score: 3948.8)
    and 2 more
    gram-positive signal peptide, YSIRK family (TIGR01168; HMM-score: 37.2)
    Metabolism Central intermediary metabolism Nitrogen fixation V-containing nitrogenase, delta subunit (TIGR02930; EC 1.18.6.1; HMM-score: 9.3)
  • TheSEED: data available for COL, NCTC8325, USA300_FPR3757
  • PFAM:
    B_GA (CL0598) GA; GA module (PF01468; HMM-score: 1478.8)
    FIVAR; FIVAR domain (PF07554; HMM-score: 1400.7)
    and 4 more
    E-set (CL0159) Rib; Rib/alpha-like repeat (PF08428; HMM-score: 43.7)
    no clan defined YSIRK_signal; YSIRK type signal peptide (PF04650; HMM-score: 35.1)
    B_GA (CL0598) GA-like; GA-like domain (PF17573; HMM-score: 19.6)
    Dim_A_B_barrel (CL0032) ydhR; Putative mono-oxygenase ydhR (PF08803; HMM-score: 6.9)

Structure, modifications & cofactors[edit | edit source]

  • domains:
  • modifications:
  • cofactors:
  • effectors:

Localization[edit | edit source]

  • PSORTb: Cellwall
    • Cytoplasmic Score: 0
    • Cytoplasmic Membrane Score: 0
    • Cellwall Score: 5.69
    • Extracellular Score: 4.31
    • Internal Helices: 0
  • LocateP: Secretory(released) (with CS)
    • Prediction by SwissProt Classification: Extracellular
    • Pathway Prediction: Sec-(SPI)
    • Intracellular possibility: -0.17
    • Signal peptide possibility: 1
    • N-terminally Anchored Score: -1
    • Predicted Cleavage Site: SQAHAAET
  • SignalP: Signal peptide SP(Sec/SPI) length 39 aa
    • SP(Sec/SPI): 0.989827
    • TAT(Tat/SPI): 0.008321
    • LIPO(Sec/SPII): 0.000673
    • Cleavage Site: CS pos: 39-40. AHA-AE. Pr: 0.9825
  • predicted transmembrane helices (TMHMM): 0

Accession numbers[edit | edit source]

Protein sequence[edit | edit source]

  • MNYRDKIQKFSIRKYTVGTFSTVIATLVFLGFNTSQAHAAETNQPASVVKQKQQSNNEQTENRESQVQNSQNSQNGQSLSATHENEQPNISQANLVDQKVAQSSTTNDEQPASQNVNTKKDSATAATTQPDKEQSKHKQNESQSANKNGNDNRAAHVENHEANVVTASDSSDNGNVQHDRNELQAFFDANYHDYRFIDRENADSGTFNYVKGIFDKINTLLGSNDPINNKDLQLAYKELEQAVALIRTMPQRQQTSRRSNRIQTRSVESRAAEPRSVSDYQNANSSYYVENANDGSGYPVGTYINASSKGAPYNLPTTPWNTLKASDSKEIALMTAKQTGDGYQWVIKFNKGHAPHQNMIFWFALPADQVPVGRTDFVTVNSDGTNVQWSHGAGAGANKPLQQMWEYGVNDPHRSHDFKIRNRSGQVIYDWPTVHIYSLEDLSRASDYFSEAGATPATKAFGRQNFEYINGQKPAESPGVPKVYTFIGQGDASYTISFKTQGPTVNKLYYAAGGRALEYNQLFMYSQLYVESTQDHQQRLNGLRQVVNRTYRIGTTKRVEVSQGNVQTKKVLESTNLNIDDFVDDPLSYVKTPSNKVLGFYSNNANTNAFRPGGAQQLNEYQLSQLFTDQKLQEAARTRNPIRLMIGFDYPDAYGNSETLVPVNLTVLPEIQHNIKFFKNDDTQNIAEKPFSKQAGHPVFYVYAGNQGNASVNLGGSVTSIQPLRINLTSNENFTDKDWQITGIPRTLHIENSTNRPNNARERNIELVGNLLPGDYFGTIRFGRKEQLFEIRVKPHTPTITTTAEQLRGTALQKVPVNISGIPLDPSALVYLVAPTNQTTNGGSEADQIPSGYTILATGTPDGVHNTITIRPQDYVVFIPPVGKQIRAVVYYNKVVASNMSNAVTILPDDIPPTINNPVGINAKYYRGDEVNFTMGVSDRHSGIKNTTITTLPNGWTSNLTKADKNNGSLSITGRVSMNQAFNSDITFKVSATDNVNNTTNDSQSKHVSIHVGKISEDAHPIVLGNTEKVVVVNPTAVSNDEKQSIITAFMNKNQNIRGYLASTDPVTVDNNGNVTLHYRDGSSTTLDATNVMTYEPVVKPEYQTVNAAKTATVTIAKGQSFSIGDIKQYFTLSNGQPIPSGTFTNITSDRTIPTAQEVSQMNAGTQLYHITATNAYHKDSEDFYISLKIIDVKQPEGDQRVYRTSTYDLTTDEISKVKQAFINANRDVITLAEGDISVTNTPNGANVSTITVNINKGRLTKSFASNLANMNFLRWVNFPQDYTVTWTNAKIANRPTDGGLSWSDDHKSLIYRYDATLGTQITTNDILTMLKATTTVPGLRNNITGNEKSQAEAGGRPNFRTTGYSQSNATTDGQRQFTLNGQVIQVLDIINPSNGYGGQPVTNSNTRANHSNSTVVNVNEPAANGAGAFTIDHVVKSNSTHNASDAVYKAQLYLTPYGPKQYVEHLNQNTGNTTDAINIYFVPSDLVNPTISVGNYTNHQVFSGETFTNTITANDNFGVQSVTVPNTSQITGTVDNNHQHVSATAPNVTSATNKTINLLATDTSGNTATTSFNVTVKPLRDKYRVGTSSTAANPVRIANISNNATVSQADQTTIINSLTFTETVPNRSYARASANEITSKTVSNVSRTGNNANVTVTVTYQDGTTSTVTVPVKHVIPEIVAHSHYTVQGQDFPAGNGSSASDYFKLSNGSDIADATITWVSGQAPNKDNTRIGEDITVTAHILIDGETTPITKTATYKVVRTVPKHVFETARGVLYPGVSDMYDAKQYVKPVNNSWSTNAQHMNFQFVGTYGPNKDVVGISTRLIRVTYDNRQTEDLTILSKVKPDPPRIDANSVTYKAGLTNQEIKVNNVLNNSSVKLFKADNTPLNVTNITHGSGFSSVVTVSDALPNGGIKAKSSISMNNVTYTTQDEHGQVVTVTRNESVDSNDSATVTVTPQLQATTEGAVFIKGGDGFDFGHVERFIQNPPHGATVAWHDSPDTWKNTVGNTHKTAVVTLPNGQGTRNVEVPVKVYPVANAKAPSRDVKGQNLTNGTDAMNYITFDPNTNTNGITAAWANRQQPNNQQAGVQHLNVDVTYPGISAAKRVPVTVNVYQFEFPQTTYTTTVGGTLASGTQASGYAHMQNATGLPTDGFTYKWNRDTTGTNDANWSAMNKPNVAKVVNAKYDVIYNGHTFATSLPAKFVVKDVQPAKPTVTETAAGAITIAPGANQTVNTHAGNVTTYADKLVIKRNGNVVTTFTRRNNTSPWVKEASAATVAGIAGTNNGITVAAGTFNPADTIQVVATQGSGETVSDEQRSDDFTVVAPQPNQATTKIWQNGHIDITPNNPSGHLINPTQAMDIAYTEKVGNGAEHSKTINVVRGQNNQWTIANKPDYVTLDAQTGKVTFNANTIKPNSSITITPKAGTGHSVSSNPSTLTAPAAHTVNTTEIVKDYGSNVTAAEINNAVQVANKRTATIKNGTAMPTNLAGGSTTTIPVTVTYNDGSTEEVQESIFTKADKRELITAKNHLDDPVSTEGKKPGTITQYNNAMHNAQQQINTAKTEAQQVINNERATPQQVSDALTKVRAAQTKIDQAKALLQNKEDNSQLVTSKNNLQSSVNQVPSTAGMTQQSIDNYNAKKREAETEITAAQRVIDNGDATAQQISDEKHRVDNALTALNQAKHDLTADTHALEQAVQQLNRTGTTTGKKPASITAYNNSIRALQSDLTSAKNSANAIIQKPIRTVQEVQSALTNVNRVNERLTQAINQLVPLADNSALKTAKTKLDEEINKSVTTDGMTQSSIQAYENAKRAGQTESTNAQNVINNGDATDQQIAAEKTKVEEKYNSLKQAIAGLTPDLAPLQTAKTQLQNDIDQPTSTTGMTSASIAAFNEKLSAARTKIQEIDRVLASHPDVATIRQNVTAANAAKSALDQARNGLTVDKAPLENAKNQLQHSIDTQTSTTGMTQDSINAYNAKLTAARNKIQQINQVLAGSPTVEQINTNTSTANQAKSDLDHARQALTPDKAPLQTAKTQLEQSINQPTDTTGMTTASLNAYNQKLQAARQKLTEINQVLNGNPTVQNINDKVTEANQAKDQLNTARQGLTLDRQPALTTLHGASNLNQAQQNNFTQQINAAQNHAALETIKSNITALNTAMTKLKDSVADNNTIKSDQNYTDATPANKQAYDNAVNAAKGVIGETTNPTMDVNTVNQKAASVKSTKDALDGQQNLQRAKTEATNAITHASDLNQAQKNALTQQVNSAQNVQAVNDIKQTTQSLNTAMTGLKRGVANHNQVVQSDNYVNADTNKKNDYNNAYNHANDIINGNAQHPVITPSDVNNALSNVTSKEHALNGEAKLNAAKQEANTALGHLNNLNNAQRQNLQSQINGAHQIDAVNTIKQNATNLNSAMGNLRQAVADKDQVKRTEDYADADTAKQNAYNSAVSSAETIINQTTNPTMSVDDVNRATSAVTSNKNALNGYEKLAQSKTDAARAIDALPHLNNAQKADVKSKINAASNIAGVNTVKQQGTDLNTAMGNLQGAINDEQTTLNSQNYQDATPSKKTAYTNAVQAAKDILNKSNGQNKTKDQVTEAMNQVNSAKNNLDGTRLLDQAKQTAKQQLNNMTHLTTAQKTNLTNQINSGTTVAGVQTVQSNANTLDQAMNTLRQSIANKDATKASEDYVDANNDKQTAYNNAVAAAETIINANSNPEMNPSTITQKAEQVNSSKTALNGDENLAAAKQNAKTYLNTLTSITDAQKNNLISQITSATRVSGVDTVKQNAQHLDQAMASLQNGINNESQVKSSEKYRDADTNKQQEYDNAITAAKAILNKSTGPNTAQNAVEAALQRVNNAKDALNGDAKLIAAQNAAKQHLGTLTHITTAQRNDLTNQISQATNLAGVESVKQNANSLDGAMGNLQTAINDKSGTLASQNFLDADEQKRNAYNQAVSAAETILNKQTGPNTAKTAVEQALNNVNNAKHALNGTQNLNNAKQAAITAINGASDLNQKQKDALKAQANGAQRVSNAQDVQHNATELNTAMGTLKHAIADKTNTLASSKYVNADSTKQNAYTTKVTNAEHIISGTPTVVTTPSEVTAAANQVNSAKQELNGDERLREAKQNANTAIDALTQLNTPQKAKLKEQVGQANRLEDVQTVQTNGQALNNAMKGLRDSIANETTVKTSQNYTDASPNNQSTYNSAVSNAKGIINQTNNPTMDTSAITQATTQVNNAKNGLNGAENLRNAQNTAKQNLNTLSHLTNNQKSAISSQIDRAGHVSEVTATKNAATELNTQMGNLEQAIHDQNTVKQSVKFTDADKAKRDAYTNAVSRAEAILNKTQGANTSKQDVEAAIQNVSSAKNALNGDQNVTNAKNAAKNALNNLTSINNAQKRDLTTKIDQATTVAGVEAVSNTSTQLNTAMANLQNGINDKTNTLASENYHDADSDKKTAYTQAVTNAENILNKNSGSNLDKTAVENALSQVANAKGALNGNHNLEQAKSNANTTINGLQHLTTAQKDKLKQQVQQAQNVAGVDTVKSSANTLNGAMGTLRNSIQDNTATKNGQNYLDATERNKTNYNNAVDSANGVINATSNPNMDANAINQIATQVTSTKNALDGTHNLTQAKQTATNAIDGATNLNKAQKDALKAQVTSAQRVANVTSIQQTANELNTAMGQLQHGIDDENATKQTQKYRDAEQSKKTAYDQAVAAAKAILNKQTGSNSDKAAVDRALQQVTSTKDALNGDAKLAEAKAAAKQNLGTLNHITNAQRTDLEGQINQATTVDGVNTVKTNANTLDGAMNSLQGSINDKDATLRNQNYLDADESKRNAYTQAVTAAEGILNKQTGGNTSKADVDNALNAVTRAKAALNGADNLRNAKTSATNTIDGLPNLTQLQKDNLKHQVEQAQNVAGVNGVKDKGNTLNTAMGALRTSIQNDNTTKTSQNYLDASDSNKNNYNTAVNNANGVINATNNPNMDANAINGMANQVNTTKAALNGAQNLAQAKTN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Experimental data[edit | edit source]

  • experimentally validated: data available for COL, NCTC8325
  • protein localization: data available for COL
  • quantitative data / protein copy number per cell:
  • interaction partners:

Expression & Regulation[edit | edit source]

Regulation[edit | edit source]

  • regulator:

Transcription pattern[edit | edit source]

Protein synthesis (provided by Aureolib)[edit | edit source]

Protein stability[edit | edit source]

  • half-life: no data available

Biological Material[edit | edit source]

Mutants[edit | edit source]

Expression vector[edit | edit source]

lacZ fusion[edit | edit source]

GFP fusion[edit | edit source]

two-hybrid system[edit | edit source]

FLAG-tag construct[edit | edit source]

Antibody[edit | edit source]

Other Information[edit | edit source]

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Literature[edit | edit source]

References[edit | edit source]

Relevant publications[edit | edit source]