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NCBI: 26-AUG-2013
⊟Summary[edit | edit source]
- organism: Staphylococcus aureus N315
- locus tag: SA1267
- pan locus tag?: SAUPAN003876000
- symbol: ebhA
- pan gene symbol?: ebhA
- synonym:
- product: hypothetical protein
⊟Genome View[edit | edit source]
⊟Gene[edit | edit source]
⊟General[edit | edit source]
- type: CDS
- locus tag: SA1267
- symbol: ebhA
- product: hypothetical protein
- replicon: chromosome
- strand: -
- coordinates: 1437928..1458069
- length: 20142
- essential: no DEG
⊟Accession numbers[edit | edit source]
- Gene ID: 1124105 NCBI
- RefSeq: NP_374548 NCBI
- BioCyc:
- MicrobesOnline: 103574 MicrobesOnline
⊟Phenotype[edit | edit source]
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⊟DNA sequence[edit | edit source]
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ACTGAACTGAACACGGCAATGGGTCAATTACAACATGCCATCGCAGATAAGACGAATACG
TTAGCAAGCAGTAAATATGTCAACGCCGATAGCACTAAACAAAATGCTTACACAACTAAA
GTTACCAATGCTGAACATATTATTAGCGGTACGCCAACGGTTGTTACAACACCTTCAGAA
GTAACAGCTGCAGCTAATCAAGTAAACAGCGCGAAACAAGAATTAAATGGTGACGAAAGA
TTACGTGTTGCAAAACAAAACGCCAATACTGCTATTGATGCATTAACGCAATTAAATACT
CCTCAAAAAGCTAAATTAAAAGAACAAGTGGGACAAGCCAATAGATTAGAAGACGTACAA
TCTGTTCAAACAAATGGACAATCATTGAACAATGCAATGAAAGGCTTAAGAGATAGTATT
GCTAACGAAACAACAGTCAAAGCAAGTCAAAACTATACAGACGCAAGTCCGAATAACCAA
TCAACATATAATAGCGCTGTGTCAAATGCGAAAGGTATCATTAATCAAACTAACAATCCA
ACTATGGATACTAGTGCGATTACCCAAGCTACAACACAAGTGAATAATGCTAAAAATGGT
TTAAACGGTGCTGAAAACTTAAGAAATGCACAAAACACTGCTAAGCAAAACTTAAATACG
TTATCACACTTAACAAATAACCAAAAATCTGCAATCTCATCACAAATTGATCGTGCAGGT
CATGTGAGTGAGGTAACAGCTGCTAAAAATGCAGCAACTGAGTTAAACGCGCAAATGGGC
AACTTGGAACAAGCTATCCATGATCAAAACACAGTTAAACAAGGTGTTAACTTCACTGAT
GCAGATAAAGCTAAACGTGATGCTTATACAAATGCGGTAAGCAGAGCAGAAACAATTCTG
AATAAAACGCAAGGTGCAAATACGTCTAAACAAGATGTTGAAGCGGCTATTCAAAATGTT
ACAAGTGCTAAAAATGCATTGAATGGTGATCAAAACGTTACAAATGCGAAGAATGCAGCT
AAAAATGCATTAAATAACTTAACGTCAATTAATAATGCACAAAAACGTGACTTAACAACT
AAAATTGATCAAGCAACAACAGTAGCTGGTGTTGAAGCGGTATCTAATACAGGTACACAA
TTGAATACAGCGATGGCTAACTTGCAAAATGGTATTAATGATAAAGCGAATACTTTAGCG
AGCGAAAACTATCATGATGCTGATTCAGATAAGAAAACTGCTTATACTCAAGCCGTTACG
AACGCAGAAAATATTTTAAATAAAAATAGTGGATCAAATTTAGATAAAGCTGCCGTTGAA
AACGCGTTGTCACAAGTGACAAATGCGAAAGGTGCCCTAAATGGTAACCATAATTTAGAG
CAAGCTAAATCAAATGCAAACACTACTATAAACGGCCTTCAACATTTAACAACAGCACAA
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AAATCAAGTGCCAACACATTAAATGGTGCTATGGGTACGTTAAGAAATAGCATACAAGAT
AACACAGCTACGAAAAATGGCCAAAACTATCTTGATGCTACAGAACGTAACAAAACAAAC
TATAACAATGCTGTTGATAGTGCTAATGGTGTCATTAATGCAACAAGCAATCCAAATATG
GATGCTAATGCAATTAACCAAATCGCTACACAAGTGACATCAACGAAAAATGCATTAGAT
GGTACACATAATTTAACGCAAGCGAAACAAACAGCAACAAATGCCATCGATGGTGCTACT
AACTTAAATAAAGCGCAAAAAGATGCGTTAAAAGCACAAGTTACAAGTGCGCAACGTGTT
GCAAATGTAACAAGTATCCAACAAACTGCAAATGAACTTAATACAGCTATGGGTCAATTA
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CAAACAGGTTCCAATTCAGATAAAGCAGCAGTTGACCGTGCATTACAACAAGTAACAAGT
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AACTTAGGTACTTTAAACCATATTACGAATGCACAACGTACTGCGTTAGAAGGTCAAATC
AATCAAGCGACGACTGTTGATGGCGTTAATACTGTAAAAACAAATGCCAATACATTAGAC
GGCGCTATGAATAGCTTACAAGGTGCAATCAATGATAAAGATGCGACATTAAGAAATCAA
AATTATCTTGATGCAGATGAATCAAAACGAAATGCATATACGCAAGCTGTCACAGCGGCT
GAAGGCATTTTAAATAAACAAACAGGTGGTAACACATCTAAAGCAGACGTTGATAATGCA
TTAAATGCAGTTACAAGAGCGAAAGCGGCTTTAAATGGTGCTGAAAACTTAAGAAATGCG
AAAACTTCAGCAACAAATACGATTAATGGTTTACCTAACTTAACACAATTACAAAAAGAC
AACTTGAAGCATCAAGTTGAACAAGCGCAAAATGTAGTTGGTGTAAATGGTGTTAAAGAT
AAAGGTAATACATTAAATACTGCCATGGGTGCATTACGTACAAGTATCCAAAATGATAAT
ACGACGAAAACAAGTCAAAATTATCTTGATGCATCTGATAGCAACAAAAATAATTACAAT
ACTGCTGTAAATAATGCAAATGGTGTTATTAATGCAACGAACAATCCAAATATGGATGCT
AATGCGATTAATGACATGGCAAATCAAGTCAATACAACAAAAGCAGCGTTAAATGGTGCA
CAAAACTTAGCTCAAGCTAAAACAAATGCGACGAACACAATTAACAACGCGCAAGACTTA
AACCAAAAACAAAAAGATGCATTAAAAACACAAGTTAACAATGCACAACGTGTATCTGAT
GCAAATAACGTTCAACATACAGCTACTGAATTGAACGGTGCGATGACAGCACTTAAAGCA
GCTATTGCGGATAAAGAAAGAACAAAAGCAAGCGGTAATTATGTCAATGCTGATCAAGAA
AAACGTCAAGCGTATGATTCAAAAGTGACTAACGCTGAAAATATCATTAATGGTACACCA
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ACAGCATTAAATGGTGATAACAACTTACGTGTAGCGAAAGAGCATGCTAACAATACAATT
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GCAACTACATTAGATGGTGTTCAAACTGTTAAAAATAGTTCTCAAACGTTGAATACAGCG
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ACAGCGAAAAACAACTTGAATAACTTAACATCAATTAACAATGCACAAAAAGATGCGTTA
ACGCGTAACATTGATGGTGCAACTACAGTAGCTGGTGTAAATCAAGAAACTGCAAAAGCA
ACAGAATTAAATAACGCAATGCACAGTTTACAAAATGGTATCAATGATGAGACACAAACA
AAACAAACTCAGAAATACCTAGATGCTGAGCCAAGTAAGAAATCAGCTTATGATCAAGCA
GTAAATGCAGCAAAAGCAATTTTAACAAAAGCTAGTGGTCAAAATGTAGACAAAGCAGCA
GTTGAACAAGCATTACAAAATGTGAACAGTACGAAGACGGCGTTGAACGGTGATGCGAAA
TTAAATGAAGCTAAAGCTGCTGCGAAACAAACGTTAGGTACATTAACACACATTAATAAT
GCACAACGTAATGCGTTAGATAATGAAATTACACAAGCAACAAATGTTGAAGGTGTTAAT
ACAGTTAAAGCCAAAGCGCAACAATTAGATGGTGCTATGGGTCAATTAGAAACATCAATT
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ACGGCTTATTCTCAAGCAGTAAATGCAGCAGCAACTATTTTAAATAAAACAGCTGGAGGA
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CAAAATACGATTAAGCAAGGTGTTAACTTCACTGATGCAGATGAAGCGAAACGTAATGCA
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TCAATTAATAATGCACAAAAAGCAGCATTGAAATCACAAATTGAAGGTGCGACAACAGTT
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AGAGATAAACAAACTGCATACAATGATGCTGTAACAGCAGCTAAAACGTTATTAGATAAA
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GCTAAAACAGCATTAAATGGTGACGCGCGATTAAATGAAGCGAAGAACACAGCTAAACAA
CAATTAGCGACAATGTCACATTTAACTAATGCTCAAAAAGCAAACTTAACAGAACAAATT
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CAAGCAATGAATCAATTAAGACAAAGTATTGCTTCTAAAGATGCGACTAAATCAAGCGAA
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GAAGGTATTATTAGTGCAACGAATAACCCTGAAATGAATCCTGATACAATTAACCAAAAA
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TCACTTAATAATGCGATGGATCAATTAAAACAAGCAATTGGTGATCATGACACAATTGTA
GCTGGTGGTAATTACACTAACGCAAGTCCTGATAAACAAGGTGCTTACACTGATGCATAT
AATGCTGCGAAGAATATCGTAAATGGTTCACCTAATGTGATTACAAATGCAGCAGATGTT
ACTGCGGCAACACAACGTGTCAATAATGCTGAAACAAGTTTAAATGGTGATACAAACTTA
GCAACTGCGAAGCAACAAGCTAAAGATGCATTACGTCAAATGACACATTTATCTGATGCA
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GTGAAAGACAATGCAACAAATCTTGACAATGCAATGAATCAACTTCGAAATAGTATTGCG
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GCATACAATACAGCAGTTACAAGTGCTGAAAATATCATTAATGCAACGAGTCAGCCAACA
CTTGATCCATCTGCAGTAACACAAGCAGCTAATCAAGTGAACACTAACAAAACTGCGCTT
AATGGTGCGCAAAACTTAGCAAATAAAAAGCAAGAAACAACTGCTAACATCAACCGATTA
AGTCATTTAAACAATGCTCAAAAGCAAGATTTAAATACACAAGTGACAAATGCACCAAAT
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CAAAACTTTGCAGATGCAGATCCAGAGAAGAAAAATGCATACAATGAAGCGGTTCGTAAT
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GATGCTCAAAAACAAGCGCTAACAACTCAAGTTGAACAAGCACCAGATATTGCAACAGTT
AATAATGTTAAGCAAAATGCTCAAAATCTGAATAATGCTATGACTAACTTAAACAATGCA
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⊟Protein[edit | edit source]
⊟General[edit | edit source]
- locus tag: SA1267
- symbol: EbhA
- description: hypothetical protein
- length: 6713
- theoretical pI: 5.38132
- theoretical MW: 722338
- GRAVY: -0.806167
⊟Function[edit | edit source]
- TIGRFAM:
- TheSEED :
- Putative Staphylococcal surface anchored protein
- PFAM: B_GA (CL0598) GA; GA module (PF01468; HMM-score: 2187.8)FIVAR; FIVAR domain (PF07554; HMM-score: 1776.9)and 2 moreDUF1542; Domain of Unknown Function (DUF1542) (PF07564; HMM-score: 299.5)TetR_C (CL0174) TetR_C_11; Bacterial transcriptional repressor C-terminal (PF16859; HMM-score: 15.2)
⊟Structure, modifications & cofactors[edit | edit source]
- domains:
- modifications:
- cofactors:
- effectors:
⊟Localization[edit | edit source]
- PSORTb: Cellwall
- Cytoplasmic Score: 0
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- Cellwall Score: 9.39
- Extracellular Score: 0.61
- Internal Helix: 1
- LocateP: Intracellular /TMH start AFTER 60
- Prediction by SwissProt Classification: Cytoplasmic
- Pathway Prediction: Possibly Sec-
- Intracellular possibility: 0.17
- Signal peptide possibility: -1
- N-terminally Anchored Score: 1
- Predicted Cleavage Site: No CleavageSite
- SignalP: no predicted signal peptide
- SP(Sec/SPI): 0.012746
- TAT(Tat/SPI): 0.004662
- LIPO(Sec/SPII): 0.001907
- predicted transmembrane helices (TMHMM): 1
⊟Accession numbers[edit | edit source]
⊟Protein sequence[edit | edit source]
- 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⊟Experimental data[edit | edit source]
- experimentally validated:
- protein localization:
- quantitative data / protein copy number per cell:
- interaction partners:
⊟Expression & Regulation[edit | edit source]
⊟Operon[edit | edit source]
⊟Regulation[edit | edit source]
- regulator:
⊟Transcription pattern[edit | edit source]
- S.aureus Expression Data Browser: no data available
⊟Protein synthesis (provided by Aureolib)[edit | edit source]
- Aureolib: no data available
⊟Protein stability[edit | edit source]
- half-life: no data available
⊟Biological Material[edit | edit source]
⊟Mutants[edit | edit source]
⊟Expression vector[edit | edit source]
⊟lacZ fusion[edit | edit source]
⊟GFP fusion[edit | edit source]
⊟two-hybrid system[edit | edit source]
⊟FLAG-tag construct[edit | edit source]
⊟Antibody[edit | edit source]
⊟Other Information[edit | edit source]
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