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NCBI: 03-AUG-2016

⊟Summary[edit | edit source]

  • organism: Staphylococcus aureus NCTC8325
  • locus tag: SAOUHSC_01447
  • pan locus tag?: SAUPAN003878000
  • symbol: SAOUHSC_01447
  • pan gene symbol?: ebh
  • synonym:
  • product: hypothetical protein

⊟Genome View[edit | edit source]

⊟Gene[edit | edit source]

⊟General[edit | edit source]

  • type: CDS
  • locus tag: SAOUHSC_01447
  • symbol: SAOUHSC_01447
  • product: hypothetical protein
  • replicon: chromosome
  • strand: -
  • coordinates: 1376091..1404698
  • length: 28608
  • essential: no DEG

⊟Accession numbers[edit | edit source]

⊟Phenotype[edit | edit source]

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⊟DNA sequence[edit | edit source]

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    GAGAATCGAGAATCTCAAGTACAAAATTCTCAAAATTCACAAAATGGTCAATCATTATCT
    GCTACTCATGAAAATGAGCAACCAAATATTAGTCAAGCTAATTTAGTAGATCAAAAAGTA
    GCGCAATCATCTACTACTAATGATGAACAACCAGCATCTCAAAATGTAAATACAAAGAAA
    GATTCGGCAACGGCTGCGACAACACAACCAGATAAAGAACAAAGTAAGCATAAACAAAAC
    GAAAGTCAATCTGCTAATAAAAATGGAAACGACAATAGAGCGGCTCATGTAGAAAATCAT
    GAAGCAAATGTAGTAACAGCTTCAGATTCATCTGATAATGGTAACGTACAACATGACCGA
    AATGAATTACAAGCGTTTTTTGATGCAAATTATCATGATTATCGCTTTATTGACCGTGAA
    AATGCAGATTCTGGCACATTTAACTATGTAAAAGGCATTTTTGATAAGATTAATACGTTA
    TTAGGCAGTAATGATCCAATAAACAATAAAGACTTGCAACTTGCATACAAAGAATTGGAA
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    AGAATTCAAACGCGTTCGGTTGAGTCAAGAGCTGCAGAGCCTAGATCAGTATCAGACTAT
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    GGTACATATATCAATGCTTCTAGTAAAGGGGCGCCATATAATTTACCAACTACACCATGG
    AATACATTGAAGGCCTCTGACTCAAAGGAAATTGCTCTTATGACAGCGAAACAAACTGGA
    GACGGGTACCAATGGGTTATTAAGTTTAATAAAGGACATGCTCCACATCAAAATATGATC
    TTTTGGTTTGCATTACCAGCAGACCAAGTGCCAGTAGGAAGAACTGACTTTGTAACAGTT
    AATTCAGATGGAACAAATGTACAATGGAGTCATGGAGCAGGAGCAGGTGCAAATAAACCA
    CTTCAACAAATGTGGGAATATGGAGTAAATGATCCTCATCGTTCACATGACTTTAAAATA
    AGAAATAGAAGTGGCCAAGTAATATATGACTGGCCAACTGTCCATATTTATTCTTTAGAA
    GATTTATCTAGAGCGAGTGATTATTTTAGTGAAGCTGGAGCGACACCTGCTACTAAAGCT
    TTTGGTAGACAAAATTTTGAATATATTAATGGTCAAAAACCTGCTGAATCACCGGGTGTT
    CCTAAAGTTTATACTTTCATCGGTCAAGGTGATGCAAGTTATACAATTTCATTTAAAACA
    CAAGGTCCAACTGTTAATAAATTGTACTATGCAGCAGGTGGGCGTGCTTTAGAGTACAAT
    CAATTATTTATGTACAGTCAACTATACGTCGAATCAACGCAAGACCATCAACAACGTCTT
    AATGGTTTAAGACAAGTGGTTAATCGTACATATCGCATAGGTACAACTAAACGTGTAGAA
    GTGAGTCAAGGAAATGTACAAACGAAAAAGGTATTAGAAAGTACAAACCTAAATATAGAT
    GATTTTGTTGATGATCCTTTAAGTTATGTTAAGACGCCGAGTAATAAAGTGTTAGGATTT
    TATTCGAATAATGCAAATACTAATGCTTTTAGACCGGGTGGAGCCCAACAATTAAATGAA
    TATCAATTAAGTCAATTATTTACTGATCAAAAATTACAAGAAGCAGCAAGAACTAGAAAC
    CCAATAAGATTAATGATTGGTTTCGACTATCCTGATGCTTATGGTAATAGTGAAACTTTA
    GTTCCTGTTAACTTAACGGTATTACCTGAAATCCAACATAATATTAAATTCTTTAAAAAT
    GACGATACTCAAAATATTGCTGAAAAACCATTTTCAAAACAAGCTGGGCATCCAGTTTTC
    TATGTATATGCAGGTAACCAAGGGAATGCTTCCGTGAATTTAGGTGGTAGCGTAACATCT
    ATTCAACCATTACGTATTAATTTAACAAGTAATGAGAATTTTACAGATAAAGATTGGCAA
    ATTACAGGTATTCCGCGTACATTACACATTGAAAACTCGACAAATAGACCTAATAATGCC
    AGAGAACGCAATATTGAACTTGTTGGTAACTTATTACCAGGGGATTACTTTGGAACGATA
    CGTTTTGGACGTAAAGAACAATTATTCGAAATTCGTGTTAAACCACATACACCAACAATT
    ACAACGACAGCTGAGCAATTAAGAGGTACAGCATTACAAAAAGTGCCTGTTAATATTTCG
    GGAATACCGTTGGATCCATCGGCATTGGTTTATTTAGTTGCACCAACAAATCAAACTACG
    AATGGTGGTAGTGAGGCAGATCAAATACCATCTGGTTATACGATACTTGCGACTGGTACA
    CCTGATGGGGTGCATAATACAATTACTATACGACCGCAAGATTATGTTGTATTCATACCA
    CCTGTAGGTAAACAAATTAGAGCAGTAGTTTATTATAATAAAGTAGTTGCATCTAATATG
    AGTAATGCTGTTACTATTTTGCCAGATGACATTCCACCAACAATCAATAATCCTGTTGGA
    ATAAATGCCAAATACTATCGAGGCGACGAAGTCAACTTTACAATGGGTGTCTCTGATAGA
    CATTCTGGTATAAAAAATACAACTATTACGACATTGCCGAATGGTTGGACATCAAATTTA
    ACAAAAGCGGATAAGAATAATGGCTCATTATCTATTACAGGTAGAGTGAGTATGAATCAG
    GCATTTAACAGTGATATTACATTTAAAGTGTCAGCGACAGACAATGTCAATAATACGACA
    AATGATAGTCAATCTAAACATGTTTCAATTCATGTAGGTAAAATTAGTGAAGATGCTCAT
    CCGATTGTATTAGGAAATACTGAGAAAGTTGTAGTAGTCAATCCGACTGCTGTATCTAAT
    GATGAAAAGCAAAGCATAATTACTGCCTTTATGAATAAAAACCAAAATATAAGAGGATAT
    TTAGCATCAACTGATCCAGTAACTGTCGATAATAATGGTAATGTCACATTACATTACCGT
    GATGGCTCATCGACAACGCTTGATGCTACAAATGTGATGACATACGAACCAGTTGTGAAA
    CCTGAATACCAAACTGTCAATGCTGCTAAAACAGCAACGGTAACGATTGCTAAAGGACAA
    TCATTTAGTATTGGTGATATTAAACAATATTTTACTTTAAGTAATGGACAACCTATTCCA
    AGTGGCACATTTACAAATATTACATCTGATAGAACTATTCCAACTGCACAAGAAGTTAGT
    CAAATGAACGCAGGCACGCAGTTATACCATATAACTGCTACAAATGCGTATCATAAAGAT
    AGTGAAGACTTCTATATTAGTTTGAAAATCATCGATGTGAAACAACCAGAAGGCGATCAA
    CGTGTATATCGTACATCAACATATGATTTAACTACTGATGAAATCTCAAAAGTAAAACAA
    GCATTTATTAATGCAAATAGAGATGTAATTACGCTTGCCGAAGGTGATATTTCAGTTACA
    AATACACCTAATGGTGCTAATGTAAGTACTATTACAGTAAATATTAATAAAGGTCGATTA
    ACGAAATCATTCGCGTCAAACCTAGCTAATATGAATTTCTTGCGTTGGGTTAATTTCCCA
    CAAGATTATACAGTGACATGGACGAATGCAAAAATTGCAAACAGACCAACAGATGGTGGT
    TTATCATGGTCTGATGACCATAAATCTTTAATTTATCGTTATGATGCTACATTAGGTACT
    CAAATTACGACGAATGATATTTTAACAATGTTAAAAGCAACAACTACAGTGCCTGGATTG
    CGAAATAACATTACTGGTAATGAAAAATCACAAGCAGAAGCTGGCGGAAGACCTAACTTT
    AGAACGACTGGTTATTCACAATCAAATGCGACAACTGATGGTCAACGTCAATTTACGTTG
    AATGGTCAAGTGATTCAAGTGTTAGACATCATCAACCCTTCAAACGGTTATGGTGGGCAA
    CCTGTTACAAATTCAAATACTCGTGCAAACCATAGTAACTCAACTGTTGTTAACGTAAAC
    GAACCGGCAGCTAATGGTGCTGGCGCATTTACAATTGACCACGTTGTAAAAAGTAATTCT
    ACACATAATGCAAGTGATGCAGTTTATAAAGCACAGTTATACTTAACGCCATATGGTCCA
    AAACAATATGTTGAACATTTAAATCAAAATACAGGAAATACTACTGACGCTATTAACATT
    TATTTTGTACCAAGTGACTTAGTGAATCCAACAATTTCAGTAGGTAATTACACTAATCAT
    CAAGTGTTCTCAGGTGAAACATTTACAAATACTATTACAGCGAATGATAACTTTGGTGTG
    CAATCTGTAACTGTACCAAATACATCACAAATTACAGGTACTGTTGATAATAACCATCAA
    CATGTTTCTGCAACGGCACCAAATGTGACATCAGCAACTAATAAGACAATCAATTTATTA
    GCAACTGATACAAGCGGCAATACAGCTACAACTTCGTTCAATGTAACAGTGAAACCTTTG
    CGTGATAAATATCGAGTTGGTACTTCATCAACGGCTGCTAATCCTGTGAGAATTGCCAAT
    ATTTCGAATAATGCGACAGTATCACAAGCTGATCAAACGACAATTATTAATTCGTTAACG
    TTTACTGAAACAGTACCAAATAGAAGTTATGCAAGAGCAAGTGCGAATGAAATCACTAGT
    AAAACAGTTAGTAATGTCAGTCGTACTGGAAATAATGCCAATGTCACAGTAACTGTTACT
    TATCAAGATGGAACAACATCAACAGTGACTGTACCTGTAAAGCATGTCATTCCAGAAATC
    GTTGCACATTCGCATTACACTGTACAAGGCCAAGACTTCCCAGCAGGTAATGGTTCTAGT
    GCATCAGATTACTTTAAGTTATCTAATGGTAGTGACATTGCAGATGCAACTATTACATGG
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    GTAAGAACTGTACCGAAACATGTCTTTGAAACAGCCAGAGGTGTTTTATACCCAGGTGTT
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    25920
    25980
    26040
    26100
    26160
    26220
    26280
    26340
    26400
    26460
    26520
    26580
    26640
    26700
    26760
    26820
    26880
    26940
    27000
    27060
    27120
    27180
    27240
    27300
    27360
    27420
    27480
    27540
    27600
    27660
    27720
    27780
    27840
    27900
    27960
    28020
    28080
    28140
    28200
    28260
    28320
    28380
    28440
    28500
    28560
    28608

⊟Protein[edit | edit source]

⊟General[edit | edit source]

  • locus tag: SAOUHSC_01447
  • symbol: SAOUHSC_01447
  • description: hypothetical protein
  • length: 9535
  • theoretical pI: 6.21172
  • theoretical MW: 1029920
  • GRAVY: -0.741206

⊟Function[edit | edit source]

  • TIGRFAM:
    hyperosmolarity resistance protein Ebh (TIGR04264; HMM-score: 3948)
    and 3 more
    gram-positive signal peptide, YSIRK family (TIGR01168; HMM-score: 36.7)
    Cellular processes Cellular processes Cell division chromosome segregation protein SMC (TIGR02168; HMM-score: 19.9)
    Genetic information processing DNA metabolism Chromosome-associated proteins chromosome segregation protein SMC (TIGR02168; HMM-score: 19.9)
  • TheSEED  :
    • Putative Staphylococcal surface anchored protein
  • PFAM:
    B_GA (CL0598) GA; GA module (PF01468; HMM-score: 2044.6)
    FIVAR; FIVAR domain (PF07554; HMM-score: 1769.5)
    and 4 more
    DUF1542; Domain of Unknown Function (DUF1542) (PF07564; HMM-score: 295)
    E-set (CL0159) Rib; Rib/alpha-like repeat (PF08428; HMM-score: 44.7)
    no clan defined YSIRK_signal; YSIRK type signal peptide (PF04650; HMM-score: 34.6)
    TetR_C (CL0174) TetR_C_11; Bacterial transcriptional repressor C-terminal (PF16859; HMM-score: 13.1)

⊟Structure, modifications & cofactors[edit | edit source]

  • domains:
  • modifications:
  • cofactors:
  • effectors:

⊟Localization[edit | edit source]

  • PSORTb: Cellwall
    • Cytoplasmic Score: 0
    • Cytoplasmic Membrane Score: 0
    • Cellwall Score: 9.39
    • Extracellular Score: 0.61
    • Internal Helix: 1
  • LocateP: Multi-transmembrane
    • Prediction by SwissProt Classification: Membrane
    • Pathway Prediction: Sec-(SPI)
    • Intracellular possibility: 0
    • Signal peptide possibility: 1
    • N-terminally Anchored Score: -1
    • Predicted Cleavage Site: No CleavageSite
  • SignalP: Signal peptide SP(Sec/SPI) length 39 aa
    • SP(Sec/SPI): 0.989827
    • TAT(Tat/SPI): 0.008321
    • LIPO(Sec/SPII): 0.000673
    • Cleavage Site: CS pos: 39-40. AHA-AE. Pr: 0.9825
  • predicted transmembrane helices (TMHMM): 1

⊟Accession numbers[edit | edit source]

⊟Protein sequence[edit | edit source]

  • MNYRDKIQKFSIRKYTVGTFSTVIATLVFLGFNTSQAHAAETNQPASVVKQKQQSNNEQTENRESQVQNSQNSQNGQSLSATHENEQPNISQANLVDQKVAQSSTTNDEQPASQNVNTKKDSATAATTQPDKEQSKHKQNESQSANKNGNDNRAAHVENHEANVVTASDSSDNGNVQHDRNELQAFFDANYHDYRFIDRENADSGTFNYVKGIFDKINTLLGSNDPINNKDLQLAYKELEQAVALIRTMPQRQQTSRRSNRIQTRSVESRAAEPRSVSDYQNANSSYYVENANDGSGYPVGTYINASSKGAPYNLPTTPWNTLKASDSKEIALMTAKQTGDGYQWVIKFNKGHAPHQNMIFWFALPADQVPVGRTDFVTVNSDGTNVQWSHGAGAGANKPLQQMWEYGVNDPHRSHDFKIRNRSGQVIYDWPTVHIYSLEDLSRASDYFSEAGATPATKAFGRQNFEYINGQKPAESPGVPKVYTFIGQGDASYTISFKTQGPTVNKLYYAAGGRALEYNQLFMYSQLYVESTQDHQQRLNGLRQVVNRTYRIGTTKRVEVSQGNVQTKKVLESTNLNIDDFVDDPLSYVKTPSNKVLGFYSNNANTNAFRPGGAQQLNEYQLSQLFTDQKLQEAARTRNPIRLMIGFDYPDAYGNSETLVPVNLTVLPEIQHNIKFFKNDDTQNIAEKPFSKQAGHPVFYVYAGNQGNASVNLGGSVTSIQPLRINLTSNENFTDKDWQITGIPRTLHIENSTNRPNNARERNIELVGNLLPGDYFGTIRFGRKEQLFEIRVKPHTPTITTTAEQLRGTALQKVPVNISGIPLDPSALVYLVAPTNQTTNGGSEADQIPSGYTILATGTPDGVHNTITIRPQDYVVFIPPVGKQIRAVVYYNKVVASNMSNAVTILPDDIPPTINNPVGINAKYYRGDEVNFTMGVSDRHSGIKNTTITTLPNGWTSNLTKADKNNGSLSITGRVSMNQAFNSDITFKVSATDNVNNTTNDSQSKHVSIHVGKISEDAHPIVLGNTEKVVVVNPTAVSNDEKQSIITAFMNKNQNIRGYLASTDPVTVDNNGNVTLHYRDGSSTTLDATNVMTYEPVVKPEYQTVNAAKTATVTIAKGQSFSIGDIKQYFTLSNGQPIPSGTFTNITSDRTIPTAQEVSQMNAGTQLYHITATNAYHKDSEDFYISLKIIDVKQPEGDQRVYRTSTYDLTTDEISKVKQAFINANRDVITLAEGDISVTNTPNGANVSTITVNINKGRLTKSFASNLANMNFLRWVNFPQDYTVTWTNAKIANRPTDGGLSWSDDHKSLIYRYDATLGTQITTNDILTMLKATTTVPGLRNNITGNEKSQAEAGGRPNFRTTGYSQSNATTDGQRQFTLNGQVIQVLDIINPSNGYGGQPVTNSNTRANHSNSTVVNVNEPAANGAGAFTIDHVVKSNSTHNASDAVYKAQLYLTPYGPKQYVEHLNQNTGNTTDAINIYFVPSDLVNPTISVGNYTNHQVFSGETFTNTITANDNFGVQSVTVPNTSQITGTVDNNHQHVSATAPNVTSATNKTINLLATDTSGNTATTSFNVTVKPLRDKYRVGTSSTAANPVRIANISNNATVSQADQTTIINSLTFTETVPNRSYARASANEITSKTVSNVSRTGNNANVTVTVTYQDGTTSTVTVPVKHVIPEIVAHSHYTVQGQDFPAGNGSSASDYFKLSNGSDIADATITWVSGQAPNKDNTRIGEDITVTAHILIDGETTPITKTATYKVVRTVPKHVFETARGVLYPGVSDMYDAKQYVKPVNNSWSTNAQHMNFQFVGTYGPNKDVVGISTRLIRVTYDNRQTEDLTILSKVKPDPPRIDANSVTYKAGLTNQEIKVNNVLNNSSVKLFKADNTPLNVTNITHGSGFSSVVTVSDALPNGGIKAKSSISMNNVTYTTQDEHGQVVTVTRNESVDSNDSATVTVTPQLQATTEGAVFIKGGDGFDFGHVERFIQNPPHGATVAWHDSPDTWKNTVGNTHKTAVVTLPNGQGTRNVEVPVKVYPVANAKAPSRDVKGQNLTNGTDAMNYITFDPNTNTNGITAAWANRQQPNNQQAGVQHLNVDVTYPGISAAKRVPVTVNVYQFEFPQTTYTTTVGGTLASGTQASGYAHMQNATGLPTDGFTYKWNRDTTGTNDANWSAMNKPNVAKVVNAKYDVIYNGHTFATSLPAKFVVKDVQPAKPTVTETAAGAITIAPGANQTVNTHAGNVTTYADKLVIKRNGNVVTTFTRRNNTSPWVKEASAATVAGIAGTNNGITVAAGTFNPADTIQVVATQGSGETVSDEQRSDDFTVVAPQPNQATTKIWQNGHIDITPNNPSGHLINPTQAMDIAYTEKVGNGAEHSKTINVVRGQNNQWTIANKPDYVTLDAQTGKVTFNANTIKPNSSITITPKAGTGHSVSSNPSTLTAPAAHTVNTTEIVKDYGSNVTAAEINNAVQVANKRTATIKNGTAMPTNLAGGSTTTIPVTVTYNDGSTEEVQESIFTKADKRELITAKNHLDDPVSTEGKKPGTITQYNNAMHNAQQQINTAKTEAQQVINNERATPQQVSDALTKVRAAQTKIDQAKALLQNKEDNSQLVTSKNNLQSSVNQVPSTAGMTQQSIDNYNAKKREAETEITAAQRVIDNGDATAQQISDEKHRVDNALTALNQAKHDLTADTHALEQAVQQLNRTGTTTGKKPASITAYNNSIRALQSDLTSAKNSANAIIQKPIRTVQEVQSALTNVNRVNERLTQAINQLVPLADNSALKTAKTKLDEEINKSVTTDGMTQSSIQAYENAKRAGQTESTNAQNVINNGDATDQQIAAEKTKVEEKYNSLKQAIAGLTPDLAPLQTAKTQLQNDIDQPTSTTGMTSASIAAFNEKLSAARTKIQEIDRVLASHPDVATIRQNVTAANAAKSALDQARNGLTVDKAPLENAKNQLQHSIDTQTSTTGMTQDSINAYNAKLTAARNKIQQINQVLAGSPTVEQINTNTSTANQAKSDLDHARQALTPDKAPLQTAKTQLEQSINQPTDTTGMTTASLNAYNQKLQAARQKLTEINQVLNGNPTVQNINDKVTEANQAKDQLNTARQGLTLDRQPALTTLHGASNLNQAQQNNFTQQINAAQNHAALETIKSNITALNTAMTKLKDSVADNNTIKSDQNYTDATPANKQAYDNAVNAAKGVIGETTNPTMDVNTVNQKAASVKSTKDALDGQQNLQRAKTEATNAITHASDLNQAQKNALTQQVNSAQNVQAVNDIKQTTQSLNTAMTGLKRGVANHNQVVQSDNYVNADTNKKNDYNNAYNHANDIINGNAQHPVITPSDVNNALSNVTSKEHALNGEAKLNAAKQEANTALGHLNNLNNAQRQNLQSQINGAHQIDAVNTIKQNATNLNSAMGNLRQAVADKDQVKRTEDYADADTAKQNAYNSAVSSAETIINQTTNPTMSVDDVNRATSAVTSNKNALNGYEKLAQSKTDAARAIDALPHLNNAQKADVKSKINAASNIAGVNTVKQQGTDLNTAMGNLQGAINDEQTTLNSQNYQDATPSKKTAYTNAVQAAKDILNKSNGQNKTKDQVTEAMNQVNSAKNNLDGTRLLDQAKQTAKQQLNNMTHLTTAQKTNLTNQINSGTTVAGVQTVQSNANTLDQAMNTLRQSIANKDATKASEDYVDANNDKQTAYNNAVAAAETIINANSNPEMNPSTITQKAEQVNSSKTALNGDENLAAAKQNAKTYLNTLTSITDAQKNNLISQITSATRVSGVDTVKQNAQHLDQAMASLQNGINNESQVKSSEKYRDADTNKQQEYDNAITAAKAILNKSTGPNTAQNAVEAALQRVNNAKDALNGDAKLIAAQNAAKQHLGTLTHITTAQRNDLTNQISQATNLAGVESVKQNANSLDGAMGNLQTAINDKSGTLASQNFLDADEQKRNAYNQAVSAAETILNKQTGPNTAKTAVEQALNNVNNAKHALNGTQNLNNAKQAAITAINGASDLNQKQKDALKAQANGAQRVSNAQDVQHNATELNTAMGTLKHAIADKTNTLASSKYVNADSTKQNAYTTKVTNAEHIISGTPTVVTTPSEVTAAANQVNSAKQELNGDERLREAKQNANTAIDALTQLNTPQKAKLKEQVGQANRLEDVQTVQTNGQALNNAMKGLRDSIANETTVKTSQNYTDASPNNQSTYNSAVSNAKGIINQTNNPTMDTSAITQATTQVNNAKNGLNGAENLRNAQNTAKQNLNTLSHLTNNQKSAISSQIDRAGHVSEVTATKNAATELNTQMGNLEQAIHDQNTVKQSVKFTDADKAKRDAYTNAVSRAEAILNKTQGANTSKQDVEAAIQNVSSAKNALNGDQNVTNAKNAAKNALNNLTSINNAQKRDLTTKIDQATTVAGVEAVSNTSTQLNTAMANLQNGINDKTNTLASENYHDADSDKKTAYTQAVTNAENILNKNSGSNLDKTAVENALSQVANAKGALNGNHNLEQAKSNANTTINGLQHLTTAQKDKLKQQVQQAQNVAGVDTVKSSANTLNGAMGTLRNSIQDNTATKNGQNYLDATERNKTNYNNAVDSANGVINATSNPNMDANAINQIATQVTSTKNALDGTHNLTQAKQTATNAIDGATNLNKAQKDALKAQVTSAQRVANVTSIQQTANELNTAMGQLQHGIDDENATKQTQKYRDAEQSKKTAYDQAVAAAKAILNKQTGSNSDKAAVDRALQQVTSTKDALNGDAKLAEAKAAAKQNLGTLNHITNAQRTDLEGQINQATTVDGVNTVKTNANTLDGAMNSLQGSINDKDATLRNQNYLDADESKRNAYTQAVTAAEGILNKQTGGNTSKADVDNALNAVTRAKAALNGADNLRNAKTSATNTIDGLPNLTQLQKDNLKHQVEQAQNVAGVNGVKDKGNTLNTAMGALRTSIQNDNTTKTSQNYLDASDSNKNNYNTAVNNANGVINATNNPNMDANAINGMANQVNTTKAALNGAQNLAQAKTNATNTINNAHDLNQKQKDALKTQVNNAQRVSDANNVQHTATELNSAMTALKAAIADKERTKASGNYVNADQEKRQAYDSKVTNAENIISGTPNATLTVNDVNSAASQVNAAKTALNGDNNLRVAKEHANNTIDGLAQLNNAQKAKLKEQVQSATTLDGVQTVKNSSQTLNTAMKGLRDSIANEATIKAGQNYTDASPNNRNEYDSAVTAAKAIINQTSNPTMEPNTITQVTSQVTTKEQALNGARNLAQAKTTAKNNLNNLTSINNAQKDALTRSIDGATTVAGVNQETAKATELNNAMHSLQNGINDETQTKQTQKYLDAEPSKKSAYDQAVNAAKAILTKASGQNVDKAAVEQALQNVNSTKTALNGDAKLNEAKAAAKQTLGTLTHINNAQRTALDNEITQATNVEGVNTVKAKAQQLDGAMGQLETSIRDKDTTLQSQNYQDADDAKRTAYSQAVNAAATILNKTAGGNTPKADVERAMQAVTQANTALNGIQNLDRAKQAANTAITNASDLNTKQKEALKAQVTSAGRVSAANGVEHTATELNTAMTALKRAIADKAETKASGNYVNADANKRQAYDEKVTAAENIVSGTPTPTLTPADVTNAATQVTNAKTQLNGNHNLEVAKQNANTAIDGLTSLNGPQKAKLKEQVGQATTLPNVQTVRDNAQTLNTAMKGLRDSIANEATIKAGQNYTDASQNKQTDYNSAVTAAKAIIGQTTSPSMNAQEINQAKDQVTAKQQALNGQENLRTAQTNAKQHLNGLSDLTDAQKDAVKRQIEGATHVNEVTQAQNNADALNTAMTNLKNGIQDQNTIKQGVNFTDADEAKRNAYTNAVTQAEQILNKAQGPNTSKDGVETALENVQRAKNELNGNQNVANAKTTAKNALNNLTSINNAQKEALKSQIEGATTVAGVNQVSTTASELNTAMSNLQNGINDEAATKAALNGTQNLEKAKQHANTAIDGLSHLTNAQKEALKQLVQQSTTVAEAQGNEQKANNVDAAMDKLRQSIADNATTKQNQNYTDASQNKKDAYNNAVTTAQGIIDQTTSPTLDPTVINQAAGQVSTTKNALNGNENLEAAKQQASQSLGSLDNLNNAQKQTVTDQINGAHTVDEANQIKQNAQNLNTAMGNLKQAIADKDATKATVNFTDADQAKQQAYNTAVTNAENIISKANGGNATQAEVEQAIKQVNAAKQALNGNANVQHAKDEATALINSSNDLNQAQKDALKQQVQNATTVAGVNNVKQTAQELNNAMTQLKQGIADKEQTKADGNFVNADPDKQNAYNQAVAKAEALISATPDVVVTPSEITAALNKVTQAKNDLNGNTNLATAKQNVQHAIDQLPNLNQAQRDEYSKQITQATLVPNVNAIQQAATTLNDAMTQLKQGIANKAQIKGSENYHDADTDKQTAYDNAVTKAEELLKQTTNPTMDPNTIQQALTKVNDTNQALNGNQKLADAKQDAKTTLGTLDHLNDAQKQALTTQVEQAPDIATVNNVKQNAQNLNNAMTNLNNALQDKTETLNSINFTDADQAKKDAYTNAVSHAEGILSKANGSNASQTEVEQAMQRVNEAKQALNGNDNVQRAKDAAKQVITNANDLNQAMTQLKQGIADKDQTKANGNFVNADTDKQNAYNNAVAHAEQIISGTPNANVDPQQVAQALQQVNQAKGDLNGNHNLQVAKDNANTAIDQLPNLNQPQKTALKDQVSHAELVTGVNAIKQNADALNNAMGTLKQQIQANSQVPQSVDFTQADQDKQQAYNNAANQAQQIANGIPTPVLTPDTVTQAVTTMNQAKDALNGDEKLAQAKQEALANLDTLRDLNQPQRDALRNQINQAQALATVEQTKQNAQNVNTAMSNLKQGIANKDTVKASENYHDADADKQTAYTNAVSQAEGIINQTTNPTLNPDEITRALTQVTDAKNGLNGEAKLATEKQNAKDAVSGMTHLNDAQKQALKGQIDQSPEIATVNQVKQTATSLDQAMDQLSQAINDKAQTLADGNYLNADPDKQNAYKQAVAKAEALLNKQSGTNEVQAQVESITNEVNAAKQALNGNDNLANAKQQAKQQLANLTHLNDAQKQSFESQITQAPLVTDVTTINQKAQTLDHAMELLRNSVADNQTTLASEDYHDATAQRQNDYNQAVTAANNIINQTTSPTMNPDDVNGATTQVNNTKVALDGDENLAAAKQQANNRLDQLDHLNNAQKQQLQSQITQSSDIAAVNGHKQTAESLNTAMGNLINAIADHQAVEQRGNFINADTDKQTAYNTAVNEAAAMINKQTGQNANQTEVEQAITKVQTTLQALNGDHNLQVAKTNATQAIDALTSLNDPQKTALKDQVTAATLVTAVHQIEQNANTLNQAMHGLRQSIQDNAATKANSKYINEDQPEQQNYDQAVQAANNIINEQTATLDNNAINQAATTVNTTKAALHGDVKLQNDKDHAKQTVSQLAHLNNAQKHMEDTLIDSETTRTAVKQDLTEAQALDQLMDALQQSIADKDATRASSAYVNAEPNKKQSYDEAVQNAESIIAGLNNPTINKGNVSSATQAVISSKNALDGVERLAQDKQTAGNSLNHLDQLTPAQQQALENQINNATTRDKVAEIIAQAQALNEAMKALKESIKDQPQTEASSKFINEDQAQKDAYTQAVQHAKDLINKTTDPTLAKSIIDQATQAVTDAKNNLHGDQKLAQDKQRATETLNNLSNLNTPQRQALENQINNAATRGEVAQKLTEAQALNQAMEALRNSIQDQQQTEAGSKFINEDKPQKDAYQAAVQNAKDLINQTNNPTLDKAQVEQLTQAVNQAKDNLHGDQKLADDKQHAVTDLNQLNGLNNPQRQALESQINNAATRGEVAQKLAEAKALDQAMQALRNSIQDQQQTESGSKFINEDKPQKDAYQAAVQNAKDLINQTGNPTLDKSQVEQLTQAVTTAKDNLHGDQKLARDQQQAVTTVNALPNLNHAQQQALTDAINAAPTRTEVAQHVQTATELDHAMETLKNKVDQVNTDKAQPNYTEASTDKKEAVDQALQAAESITDPTNGSNANKDAVDQVLTKLQEKENELNGNERVAEAKTQAKQTIDQLTHLNADQIATAKQNIDQATKLQPIAELVDQATQLNQSMDQLQQAVNEHANVEQTVDYTQADSDKQNAYKQAIADAENVLKQNANKQQVDQALQNILNAKQALNGDERVALAKTNGKHDIDQLNALNNAQQDGFKGRIDQSNDLNQIQQIVDEAKALNRAMDQLSQEITDNEGRTKGSTNYVNADTQVKQVYDETVDKAKQALDKSTGQNLTAKQVIKLNDAVTAAKKALNGEERLNNRKAEALQRLDQLTHLNNAQRQLAIQQINNAETLNKASRAINRATKLDNAMGSVQQYIDEQHLGVISSTNYINADDNLKANYDNAIANAAHELDKVQGNAIAKAEAEQLKQNIIDAQNALNGDQNLANAKDKANAFVNSLNGLNQQQQDLAHKAINNADTVSDVTDIVNNQIDLNDAMETLKHLVDNEIPNAEQTVNYQNADDNAKTNFDDAKRLANTLLNSDNTNVNDINGAIQAVNDAIHNLNGDQRLQDAKDKAIQSINQALANKLKEIEASNATDQDKLIAKNKAEELANSIINNINKATSNQAVSQVQTAGNHAIEQVHANEIPKAKIDANKDVDKQVQALIDEIDRNPNLTDKEKQALKDRINQILQQGHNGINNAMTKEEIEQAKAQLAQALQDIKDLVKAKEDAKQDVDKQVQALIDEIDQNPNLTDKEKQALKDRINQILQQGHNDINNAMTKEAIEQAKERLAQALQDIKDLVKAKEDAKNDIDKRVQALIDEIDQNPNLTDKEKQALKDRINQILQQGHNDINNALTKEEIEQAKAQLAQALQDIKDLVKAKEDAKNAIKALANAKRDQINSNPDLTPEQKAKALKEIDEAEKRALQNVENAQTIDQLNRGLNLGLDDIRNTHVWEVDEQPAVNEIFEATPEQILVNGELIVHRDDIITEQDILAHINLIDQLSAEVIDTPSTATISDSLTAKVEVTLLDGSKVIVNVPVKVVEKELSVVKQQAIESIENAAQQKINEINNSVTLTLEQKEAAIAEVNKLKQQAIDHVNNAPDVHSVEEIQQQEQAHIEQFNPEQFTIEQAKSNAIKSIEDAIQHMIDEIKARTDLTDKEKQEAIAKLNQLKEQAIQAIQRAQSIDEISEQLEQFKAQMKAANPTAKELAKRKQEAISRIKDFSNEKINSIRNSEIGTADEKQAAMNQINEIVLETIRDINNAHTLQQVEAALNNGIARISAVQIVTSDRAKQSSSTGNESNSHLTIGYGTANHPFNSSTIGHKKKLDEDDDIDPLHMRHFSNNFGNVIKNAIGVVGISGLLASFWFFIAKRRRKEDEEEELEIRDNNKDSIKETLDDTKHLPLLFAKRRRKEDEEDVTVEEKDSLNNGESLDKVKHTPFFLPKRRRKEDEEDVEVTNENTDEKVLKDNEHSPLLFAKRRKDKEEDVETTTSIESKDEDVPLLLAKKKNQKDNQSKDKKSASKNTSKKVAAKKKKKKAKKNKK

⊟Experimental data[edit | edit source]

  • experimentally validated: PeptideAtlas [1] [2]
  • protein localization: data available for COL
  • quantitative data / protein copy number per cell:
  • interaction partners:

⊟Expression & Regulation[edit | edit source]

⊟Operon[edit | edit source]

⊟Regulation[edit | edit source]

  • regulator:

⊟Transcription pattern[edit | edit source]

⊟Protein synthesis (provided by Aureolib)[edit | edit source]

⊟Protein stability[edit | edit source]

  • half-life: no data available

⊟Biological Material[edit | edit source]

⊟Mutants[edit | edit source]

⊟Expression vector[edit | edit source]

⊟lacZ fusion[edit | edit source]

⊟GFP fusion[edit | edit source]

⊟two-hybrid system[edit | edit source]

⊟FLAG-tag construct[edit | edit source]

⊟Antibody[edit | edit source]

⊟Other Information[edit | edit source]

You are kindly invited to share additional interesting facts.

⊟Literature[edit | edit source]

⊟References[edit | edit source]

  1. ↑ Maren Depke, Stephan Michalik, Alexander Rabe, Kristin Surmann, Lars Brinkmann, Nico Jehmlich, Jörg Bernhardt, Michael Hecker, Bernd Wollscheid, Zhi Sun, Robert L Moritz, Uwe Völker, Frank Schmidt
    A peptide resource for the analysis of Staphylococcus aureus in host-pathogen interaction studies.
    Proteomics: 2015, 15(21);3648-61
    [PubMed:26224020] [WorldCat.org] [DOI] (I p)
  2. ↑ Stephan Michalik, Maren Depke, Annette Murr, Manuela Gesell Salazar, Ulrike Kusebauch, Zhi Sun, Tanja C Meyer, Kristin Surmann, Henrike Pförtner, Petra Hildebrandt, Stefan Weiss, Laura Marcela Palma Medina, Melanie Gutjahr, Elke Hammer, Dörte Becher, Thomas Pribyl, Sven Hammerschmidt, Eric W Deutsch, Samuel L Bader, Michael Hecker, Robert L Moritz, Ulrike Mäder, Uwe Völker, Frank Schmidt
    A global Staphylococcus aureus proteome resource applied to the in vivo characterization of host-pathogen interactions.
    Sci Rep: 2017, 7(1);9718
    [PubMed:28887440] [WorldCat.org] [DOI] (I e)
  3. ↑ Ulrike Mäder, Pierre Nicolas, Maren Depke, Jan Pané-Farré, Michel Debarbouille, Magdalena M van der Kooi-Pol, Cyprien Guérin, Sandra Dérozier, Aurelia Hiron, Hanne Jarmer, Aurélie Leduc, Stephan Michalik, Ewoud Reilman, Marc Schaffer, Frank Schmidt, Philippe Bessières, Philippe Noirot, Michael Hecker, Tarek Msadek, Uwe Völker, Jan Maarten van Dijl
    Staphylococcus aureus Transcriptome Architecture: From Laboratory to Infection-Mimicking Conditions.
    PLoS Genet: 2016, 12(4);e1005962
    [PubMed:27035918] [WorldCat.org] [DOI] (I e)

⊟Relevant publications[edit | edit source]

Simon R Clarke, Llinos G Harris, R Geoff Richards, Simon J Foster
Analysis of Ebh, a 1.1-megadalton cell wall-associated fibronectin-binding protein of Staphylococcus aureus.
Infect Immun: 2002, 70(12);6680-7
[PubMed:12438342] [WorldCat.org] [DOI] (P p)

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