⊟Summary[edit | edit source]
- organism: Staphylococcus aureus COL
- locus tag: SACOL1472 [new locus tag: SACOL_RS07510 ]
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- synonym:
- product: cell wall associated fibronectin-binding protein
⊟Genome View[edit | edit source]
⊟Gene[edit | edit source]
⊟General[edit | edit source]
- type: CDS
- locus tag: SACOL1472 [new locus tag: SACOL_RS07510 ]
- symbol: ebh
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- replicon: chromosome
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- length: 31497
- essential: unknown other strains
⊟Accession numbers[edit | edit source]
- Gene ID: 3237115 NCBI
- RefSeq: YP_186319 NCBI
- BioCyc: see SACOL_RS07510
- MicrobesOnline: 912927 MicrobesOnline
⊟Phenotype[edit | edit source]
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⊟DNA sequence[edit | edit source]
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GAAACAAATCAACCAGCAAGCGTGGTTAAACAGAAACAACAAAGTAATAATGAACAGACT
GAGAATCGAGAATCTCAAGTACAAAATTCTCAAAATTCACAAAATGGTCAATCATTATCT
GCTACTCATGAAAATGAGCAACCAAATATTAGTCAAGCTAATTTAGTAGATCAAAAAGTA
GCGCAATCATCTACTACTAATGATGAACAACCAGCATCTCAAAATGTAAATACAAAGAAA
GATTCGGCAACGGCTGCGACAACACAACCAGATAAAGAACAAAGTAAGCATAAACAAAAC
GAAAGTCAATCTGCTAATAAAAATGGAAACGACAATAGAGCGGCTCATGTAGAAAATCAT
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AATGCAGATTCTGGCACATTTAACTATGTAAAAGGCATTTTTGATAAGATTAATACGTTA
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AGAATTCAAACGCGTTCGGTTGAGTCAAGAGCTGCAGAGCCTAGATCAGTATCAGACTAT
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AATACATTGAAGGCCTCTGACTCAAAGGAAATTGCTCTTATGACAGCGAAACAAACTGGA
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TTTTGGTTTGCATTACCAGCAGACCAAGTGCCAGTAGGAAGAACTGACTTTGTAACAGTT
AATTCAGATGGAACAAATGTACAATGGAGTCATGGAGCAGGAGCAGGTGCAAATAAACCA
CTTCAACAAATGTGGGAATATGGAGTAAATGATCCTCATCGTTCACATGACTTTAAAATA
AGAAATAGAAGTGGCCAAGTAATATATGACTGGCCAACTGTCCATATTTATTCTTTAGAA
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CCTAAAGTTTATACTTTCATCGGTCAAGGTGATGCAAGTTATACAATTTCATTTAAAACA
CAAGGTCCAACTGTTAATAAATTGTACTATGCAGCAGGTGGGCGTGCTTTAGAGTACAAT
CAATTATTTATGTACAGTCAACTATACGTCGAATCAACGCAAGACCATCAACAACGTCTT
AATGGTTTAAGACAAGTGGTTAATCGTACATATCGCATAGGTACAACTAAACGTGTAGAA
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GATTTTGTTGATGATCCTTTAAGTTATGTTAAGACGCCGAGTAATAAAGTGTTAGGATTT
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GACGATACTCAAAATATTGCTGAAAAACCATTTTCAAAACAAGCTGGGCATCCAGTTTTC
TATGTATATGCAGGTAACCAAGGGAATGCTTCCGTGAATTTAGGTGGTAGCGTAACATCT
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CATTCTGGTATAAAAAATACAACTATTACGACATTGCCGAATGGTTGGACATCAAATTTA
ACAAAAGCGGATAAGAATAATGGCTCATTATCTATTACAGGTAGAGTGAGTATGAATCAG
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AATGATAGTCAATCTAAACATGTTTCAATTCATGTAGGTAAAATTAGTGAAGATGCTCAT
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GATGAAAAGCAAAGCATAATTACTGCCTTTATGAATAAAAACCAAAATATAAGAGGATAT
TTAGCATCAACTGATCCAGTAACTGTCGATAATAATGGTAATGTCACATTACATTACCGT
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TCATTTAGTATTGGTGATATTAAACAATATTTTACTTTAAGTAATGGACAACCTATTCCA
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AGTGAAGACTTCTATATTAGTTTGAAAATCATCGATGTGAAACAACCAGAAGGCGATCAA
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CAATCTGTAACTGTACCAAATACATCACAAATTACAGGTACTGTTGATAATAACCATCAA
CATGTTTCTGCAACGGCACCAAATGTGACATCAGCAACTAATAAGACAATCAATTTATTA
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CGTGATAAATATCGAGTTGGTACTTCATCAACGGCTGCTAATCCTGTGAGAATTGCCAAT
ATTTCGAATAATGCGACAGTATCACAAGCTGATCAAACGACAATTATTAATTCGTTAACG
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AAAACAGTTAGTAATGTCAGTCGTACTGGAAATAATGCCAATGTCACAGTAACTGTTACT
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GCATCAGATTACTTTAAGTTATCTAATGGTAGTGACATTGCAGATGCAACTATTACATGG
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GCACATATCTTAATTGATGGCGAAACAACGCCGATTACGAAAACAGCAACATATAAAGTA
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TCAGATATGTATGATGCGAAACAATATGTTAAGCCAGTAAATAATTCTTGGTCGACAAAT
GCGCAACATATGAATTTCCAATTTGTTGGAACATATGGTCCTAACAAAGATGTTGTAGGC
ATATCTACTCGTCTTATTAGAGTGACATATGATAATAGACAAACAGAAGATTTAACTATT
TTATCTAAAGTTAAACCTGACCCACCTAGAATTGACGCAAACTCTGTGACATATAAAGCA
GGTCTTACAAACCAAGAAATTAAAGTTAATAACGTATTAAATAACTCGTCAGTAAAATTA
TTTAAAGCAGATAATACACCATTAAATGTCACAAATATTACTCATGGTAGCGGTTTTAGT
TCGGTTGTGACAGTAAGTGACGCGTTACCAAATGGCGGAATTAAAGCAAAATCTTCAATT
TCAATGAACAATGTGACGTATACGACGCAAGACGAACATGGTCAAGTTGTTACAGTAACA
AGAAATGAATCTGTTGATTCAAATGACAGTGCAACAGTAACAGTGACACCACAATTACAA
GCAACTACTGAAGGCGCTGTATTTATTAAAGGTGGCGACGGTTTTGATTTCGGACACGTA
GAAAGATTTATTCAAAACCCGCCACATGGGGCAACGGTTGCATGGCATGATAGTCCAGAT
ACATGGAAGAATACAGTCGGTAACACTCATAAAACTGCGGTTGTAACATTACCTAATGGT
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CATATGCAAAATGCTACTGGTTTACCAACAGATGGATTTACGTATAAATGGAATCGTGAT
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GCGATTACAATTGCACCTGGAGCAAACCAAACAGTGAATACACATGCCGGTAACGTAACG
ACATACGCTGATAAATTAGTTATTAAACGTAATGGTAACGTTGTGACGACATTTACACGT
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GGAACTAATAATGGTATTACTGTTGCAGCAGGTACTTTCAACCCTGCTGATACAATTCAA
GTTGTTGCAACGCAAGGAAGCGGAGAGACAGTGAGTGATGAGCAACGTAGTGATGATTTC
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AATGATGGTAGTACTGAAGAAGTACAAGAGTCCATTTTCACAAAAGCGGATAAACGTGAG
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GTACCATCAACTGCTGGTATGACGCAACAAAGTATTGATAACTATAATGCGAAGAAGCGT
GAAGCAGAAACTGAAATAACTGCAGCTCAACGTGTTATTGACAATGGCGATGCAACTGCA
CAACAAATTTCAGATGAAAAACATCGTGTCGATAACGCATTAACAGCATTAAACCAAGCG
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CAAGACAAACAACAAGCATATAACAATGCGGCTAACCAAGCGCAACAAATCGCAAATGGC
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GACAATTTGGCAAATGCAAAACAACAAGCAAAACAACAATTGGCGAACTTAACACACTTA
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⊟Protein[edit | edit source]
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- theoretical pI: 6.13277
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⊟Function[edit | edit source]
- TIGRFAM: hyperosmolarity resistance protein Ebh (TIGR04264; HMM-score: 3947.8)and 3 moregram-positive signal peptide, YSIRK family (TIGR01168; HMM-score: 36.6)Cellular processes Cell division chromosome segregation protein SMC (TIGR02168; HMM-score: 19.4)DNA metabolism Chromosome-associated proteins chromosome segregation protein SMC (TIGR02168; HMM-score: 19.4)
- TheSEED :
- Putative Staphylococcal surface anchored protein
- PFAM: B_GA (CL0598) GA; GA module (PF01468; HMM-score: 2411.1)FIVAR; FIVAR domain (PF07554; HMM-score: 2060.7)and 3 moreDUF1542; Domain of Unknown Function (DUF1542) (PF07564; HMM-score: 292.9)E-set (CL0159) Rib; Rib/alpha-like repeat (PF08428; HMM-score: 43.9)no clan defined YSIRK_signal; YSIRK type signal peptide (PF04650; HMM-score: 34.5)
⊟Structure, modifications & cofactors[edit | edit source]
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⊟Localization[edit | edit source]
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⊟Accession numbers[edit | edit source]
⊟Protein sequence[edit | edit source]
- 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⊟Experimental data[edit | edit source]
- experimentally validated: PeptideAtlas
- protein localization: Cell wall associated [1] [2]
- quantitative data / protein copy number per cell:
- interaction partners:
⊟Expression & Regulation[edit | edit source]
⊟Operon[edit | edit source]
- MicrobesOnline: no polycistronic organisation predicted
⊟Regulation[edit | edit source]
- regulator:
⊟Transcription pattern[edit | edit source]
- S.aureus Expression Data Browser: data available for NCTC8325
⊟Protein synthesis (provided by Aureolib)[edit | edit source]
- Aureolib: no data available
⊟Protein stability[edit | edit source]
- half-life: no data available
⊟Biological Material[edit | edit source]
⊟Mutants[edit | edit source]
⊟Expression vector[edit | edit source]
⊟lacZ fusion[edit | edit source]
⊟GFP fusion[edit | edit source]
⊟two-hybrid system[edit | edit source]
⊟FLAG-tag construct[edit | edit source]
⊟Antibody[edit | edit source]
⊟Other Information[edit | edit source]
You are kindly invited to share additional interesting facts.
⊟Literature[edit | edit source]
⊟References[edit | edit source]
- ↑ Dörte Becher, Kristina Hempel, Susanne Sievers, Daniela Zühlke, Jan Pané-Farré, Andreas Otto, Stephan Fuchs, Dirk Albrecht, Jörg Bernhardt, Susanne Engelmann, Uwe Völker, Jan Maarten van Dijl, Michael Hecker
A proteomic view of an important human pathogen--towards the quantification of the entire Staphylococcus aureus proteome.
PLoS One: 2009, 4(12);e8176
[PubMed:19997597] [WorldCat.org] [DOI] (I e) - ↑ Andreas Otto, Jan Maarten van Dijl, Michael Hecker, Dörte Becher
The Staphylococcus aureus proteome.
Int J Med Microbiol: 2014, 304(2);110-20
[PubMed:24439828] [WorldCat.org] [DOI] (I p)
⊟Relevant publications[edit | edit source]
Simon R Clarke, Llinos G Harris, R Geoff Richards, Simon J Foster
Analysis of Ebh, a 1.1-megadalton cell wall-associated fibronectin-binding protein of Staphylococcus aureus.
Infect Immun: 2002, 70(12);6680-7
[PubMed:12438342] [WorldCat.org] [DOI] (P p)Yoshikazu Tanaka, Sou Sakamoto, Makoto Kuroda, Shuichiro Goda, Yong-Gui Gao, Kouhei Tsumoto, Yuzuru Hiragi, Min Yao, Nobuhisa Watanabe, Toshiko Ohta, Isao Tanaka
A helical string of alternately connected three-helix bundles for the cell wall-associated adhesion protein Ebh from Staphylococcus aureus.
Structure: 2008, 16(3);488-96
[PubMed:18334223] [WorldCat.org] [DOI] (P p)