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NCBI: 02-MAR-2017

Summary[edit | edit source]

  • organism: Staphylococcus aureus COL
  • locus tag: SACOL_RS07510 [old locus tag: SACOL1472 ]
  • pan locus tag?: SAUPAN003878000
  • symbol: SACOL_RS07510
  • pan gene symbol?: ebh
  • synonym:
  • product: hyperosmolarity resistance protein Ebh

Genome View[edit | edit source]

Gene[edit | edit source]

General[edit | edit source]

  • type: CDS
  • locus tag: SACOL_RS07510 [old locus tag: SACOL1472 ]
  • symbol: SACOL_RS07510
  • product: hyperosmolarity resistance protein Ebh
  • replicon: chromosome
  • strand: -
  • coordinates: 1479867..1511363
  • length: 31497
  • essential: unknown other strains

Accession numbers[edit | edit source]

  • Location: NC_002951 (1479867..1511363) NCBI
  • BioCyc: SACOL_RS07510 BioCyc
  • MicrobesOnline: see SACOL1472

Phenotype[edit | edit source]

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DNA sequence[edit | edit source]

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    GAAACAAATCAACCAGCAAGCGTGGTTAAACAGAAACAACAAAGTAATAATGAACAGACT
    GAGAATCGAGAATCTCAAGTACAAAATTCTCAAAATTCACAAAATGGTCAATCATTATCT
    GCTACTCATGAAAATGAGCAACCAAATATTAGTCAAGCTAATTTAGTAGATCAAAAAGTA
    GCGCAATCATCTACTACTAATGATGAACAACCAGCATCTCAAAATGTAAATACAAAGAAA
    GATTCGGCAACGGCTGCGACAACACAACCAGATAAAGAACAAAGTAAGCATAAACAAAAC
    GAAAGTCAATCTGCTAATAAAAATGGAAACGACAATAGAGCGGCTCATGTAGAAAATCAT
    GAAGCAAATGTAGTAACAGCTTCAGATTCATCTGATAATGGTAACGTACAACATGACCGA
    AATGAATTACAAGCGTTTTTTGATGCAAATTATCATGATTATCGCTTTATTGACCGTGAA
    AATGCAGATTCTGGCACATTTAACTATGTAAAAGGCATTTTTGATAAGATTAATACGTTA
    TTAGGCAGTAATGATCCAATAAACAATAAAGACTTGCAACTTGCATACAAAGAATTGGAA
    CAAGCTGTTGCTTTAATTCGTACAATGCCTCAACGTCAACAGACTAGCCGACGTTCAAAT
    AGAATTCAAACGCGTTCGGTTGAGTCAAGAGCTGCAGAGCCTAGATCAGTATCAGACTAT
    CAAAATGCAAATTCATCATATTATGTTGAAAATGCTAATGATGGTTCGGGCTATCCTGTT
    GGTACATATATCAATGCTTCTAGTAAAGGGGCGCCATATAATTTACCAACTACACCATGG
    AATACATTGAAGGCCTCTGACTCAAAGGAAATTGCTCTTATGACAGCGAAACAAACTGGA
    GACGGGTACCAATGGGTTATTAAGTTTAATAAAGGACATGCTCCACATCAAAATATGATC
    TTTTGGTTTGCATTACCAGCAGACCAAGTGCCAGTAGGAAGAACTGACTTTGTAACAGTT
    AATTCAGATGGAACAAATGTACAATGGAGTCATGGAGCAGGAGCAGGTGCAAATAAACCA
    CTTCAACAAATGTGGGAATATGGAGTAAATGATCCTCATCGTTCACATGACTTTAAAATA
    AGAAATAGAAGTGGCCAAGTAATATATGACTGGCCAACTGTCCATATTTATTCTTTAGAA
    GATTTATCTAGAGCGAGTGATTATTTTAGTGAAGCTGGAGCGACACCTGCTACTAAAGCT
    TTTGGTAGACAAAATTTTGAATATATTAATGGTCAAAAACCTGCTGAATCACCGGGTGTT
    CCTAAAGTTTATACTTTCATCGGTCAAGGTGATGCAAGTTATACAATTTCATTTAAAACA
    CAAGGTCCAACTGTTAATAAATTGTACTATGCAGCAGGTGGGCGTGCTTTAGAGTACAAT
    CAATTATTTATGTACAGTCAACTATACGTCGAATCAACGCAAGACCATCAACAACGTCTT
    AATGGTTTAAGACAAGTGGTTAATCGTACATATCGCATAGGTACAACTAAACGTGTAGAA
    GTGAGTCAAGGAAATGTACAAACGAAAAAGGTATTAGAAAGTACAAACCTAAATATAGAT
    GATTTTGTTGATGATCCTTTAAGTTATGTTAAGACGCCGAGTAATAAAGTGTTAGGATTT
    TATTCGAATAATGCAAATACTAATGCTTTTAGACCGGGTGGAGCCCAACAATTAAATGAA
    TATCAATTAAGTCAATTATTTACTGATCAAAAATTACAAGAAGCAGCAAGAACTAGAAAC
    CCAATAAGATTAATGATTGGTTTCGACTATCCTGATGCTTATGGTAATAGTGAAACTTTA
    GTTCCTGTTAACTTAACGGTATTACCTGAAATCCAACATAATATTAAATTCTTTAAAAAT
    GACGATACTCAAAATATTGCTGAAAAACCATTTTCAAAACAAGCTGGGCATCCAGTTTTC
    TATGTATATGCAGGTAACCAAGGGAATGCTTCCGTGAATTTAGGTGGTAGCGTAACATCT
    ATTCAACCATTACGTATTAATTTAACAAGTAATGAGAATTTTACAGATAAAGATTGGCAA
    ATTACAGGTATTCCGCGTACATTACACATTGAAAACTCGACAAATAGACCTAATAATGCC
    AGAGAACGCAATATTGAACTTGTTGGTAACTTATTACCAGGGGATTACTTTGGAACGATA
    CGTTTTGGACGTAAAGAACAATTATTCGAAATTCGTGTTAAACCACATACACCAACAATT
    ACAACGACAGCTGAGCAATTAAGAGGTACAGCATTACAAAAAGTGCCTGTTAATATTTCG
    GGAATACCGTTGGATCCATCGGCATTGGTTTATTTAGTTGCACCAACAAATCAAACTACG
    AATGGTGGTAGTGAGGCAGATCAAATACCATCTGGTTATACGATACTTGCGACTGGTACA
    CCTGATGGGGTGCATAATACAATTACTATACGACCGCAAGATTATGTTGTATTCATACCA
    CCTGTAGGTAAACAAATTAGAGCAGTAGTTTATTATAATAAAGTAGTTGCATCTAATATG
    AGTAATGCTGTTACTATTTTGCCAGATGACATTCCACCAACAATCAATAATCCTGTTGGA
    ATAAATGCCAAATACTATCGAGGCGACGAAGTCAACTTTACAATGGGTGTCTCTGATAGA
    CATTCTGGTATAAAAAATACAACTATTACGACATTGCCGAATGGTTGGACATCAAATTTA
    ACAAAAGCGGATAAGAATAATGGCTCATTATCTATTACAGGTAGAGTGAGTATGAATCAG
    GCATTTAACAGTGATATTACATTTAAAGTGTCAGCGACAGACAATGTCAATAATACGACA
    AATGATAGTCAATCTAAACATGTTTCAATTCATGTAGGTAAAATTAGTGAAGATGCTCAT
    CCGATTGTATTAGGAAATACTGAGAAAGTTGTAGTAGTCAATCCGACTGCTGTATCTAAT
    GATGAAAAGCAAAGCATAATTACTGCCTTTATGAATAAAAACCAAAATATAAGAGGATAT
    TTAGCATCAACTGATCCAGTAACTGTCGATAATAATGGTAATGTCACATTACATTACCGT
    GATGGCTCATCGACAACGCTTGATGCTACAAATGTGATGACATACGAACCAGTTGTGAAA
    CCTGAATACCAAACTGTCAATGCTGCTAAAACAGCAACGGTAACGATTGCTAAAGGACAA
    TCATTTAGTATTGGTGATATTAAACAATATTTTACTTTAAGTAATGGACAACCTATTCCA
    AGTGGCACATTTACAAATATTACATCTGATAGAACTATTCCAACTGCACAAGAAGTTAGT
    CAAATGAACGCAGGCACGCAGTTATACCATATAACTGCTACAAATGCGTATCATAAAGAT
    AGTGAAGACTTCTATATTAGTTTGAAAATCATCGATGTGAAACAACCAGAAGGCGATCAA
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    GCATTTATTAATGCAAATAGAGATGTAATTACGCTTGCCGAAGGTGATATTTCAGTTACA
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    CAAATTACGACGAATGATATTTTAACAATGTTAAAAGCAACAACTACAGTGCCTGGATTG
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    AGAACGACTGGTTATTCACAATCAAATGCGACAACTGATGGTCAACGTCAATTTACGTTG
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    31380
    31440
    31497

Protein[edit | edit source]

General[edit | edit source]

  • locus tag: SACOL_RS07510 [old locus tag: SACOL1472 ]
  • symbol: SACOL_RS07510
  • description: hyperosmolarity resistance protein Ebh
  • length: 10498
  • theoretical pI: 6.13277
  • theoretical MW: 1131320
  • GRAVY: -0.744018

Function[edit | edit source]

  • TIGRFAM:
    hyperosmolarity resistance protein Ebh (TIGR04264; HMM-score: 3947.8)
    and 3 more
    gram-positive signal peptide, YSIRK family (TIGR01168; HMM-score: 36.6)
    Cellular processes Cellular processes Cell division chromosome segregation protein SMC (TIGR02168; HMM-score: 19.4)
    Genetic information processing DNA metabolism Chromosome-associated proteins chromosome segregation protein SMC (TIGR02168; HMM-score: 19.4)
  • TheSEED: see SACOL1472
  • PFAM:
    B_GA (CL0598) GA; GA module (PF01468; HMM-score: 2411.1)
    FIVAR; FIVAR domain (PF07554; HMM-score: 2060.7)
    and 3 more
    DUF1542; Domain of Unknown Function (DUF1542) (PF07564; HMM-score: 292.9)
    E-set (CL0159) Rib; Rib/alpha-like repeat (PF08428; HMM-score: 43.9)
    no clan defined YSIRK_signal; YSIRK type signal peptide (PF04650; HMM-score: 34.5)

Structure, modifications & cofactors[edit | edit source]

  • domains:
  • modifications:
  • cofactors:
  • effectors:

Localization[edit | edit source]

  • PSORTb: Cellwall
    • Cytoplasmic Score: 0
    • Cytoplasmic Membrane Score: 0
    • Cellwall Score: 9.39
    • Extracellular Score: 0.61
    • Internal Helix: 1
  • LocateP:
  • SignalP: Signal peptide SP(Sec/SPI) length 39 aa
    • SP(Sec/SPI): 0.989827
    • TAT(Tat/SPI): 0.008321
    • LIPO(Sec/SPII): 0.000673
    • Cleavage Site: CS pos: 39-40. AHA-AE. Pr: 0.9825
  • predicted transmembrane helices (TMHMM): 1

Accession numbers[edit | edit source]

Protein sequence[edit | edit source]

  • MNYRDKIQKFSIRKYTVGTFSTVIATLVFLGFNTSQAHAAETNQPASVVKQKQQSNNEQTENRESQVQNSQNSQNGQSLSATHENEQPNISQANLVDQKVAQSSTTNDEQPASQNVNTKKDSATAATTQPDKEQSKHKQNESQSANKNGNDNRAAHVENHEANVVTASDSSDNGNVQHDRNELQAFFDANYHDYRFIDRENADSGTFNYVKGIFDKINTLLGSNDPINNKDLQLAYKELEQAVALIRTMPQRQQTSRRSNRIQTRSVESRAAEPRSVSDYQNANSSYYVENANDGSGYPVGTYINASSKGAPYNLPTTPWNTLKASDSKEIALMTAKQTGDGYQWVIKFNKGHAPHQNMIFWFALPADQVPVGRTDFVTVNSDGTNVQWSHGAGAGANKPLQQMWEYGVNDPHRSHDFKIRNRSGQVIYDWPTVHIYSLEDLSRASDYFSEAGATPATKAFGRQNFEYINGQKPAESPGVPKVYTFIGQGDASYTISFKTQGPTVNKLYYAAGGRALEYNQLFMYSQLYVESTQDHQQRLNGLRQVVNRTYRIGTTKRVEVSQGNVQTKKVLESTNLNIDDFVDDPLSYVKTPSNKVLGFYSNNANTNAFRPGGAQQLNEYQLSQLFTDQKLQEAARTRNPIRLMIGFDYPDAYGNSETLVPVNLTVLPEIQHNIKFFKNDDTQNIAEKPFSKQAGHPVFYVYAGNQGNASVNLGGSVTSIQPLRINLTSNENFTDKDWQITGIPRTLHIENSTNRPNNARERNIELVGNLLPGDYFGTIRFGRKEQLFEIRVKPHTPTITTTAEQLRGTALQKVPVNISGIPLDPSALVYLVAPTNQTTNGGSEADQIPSGYTILATGTPDGVHNTITIRPQDYVVFIPPVGKQIRAVVYYNKVVASNMSNAVTILPDDIPPTINNPVGINAKYYRGDEVNFTMGVSDRHSGIKNTTITTLPNGWTSNLTKADKNNGSLSITGRVSMNQAFNSDITFKVSATDNVNNTTNDSQSKHVSIHVGKISEDAHPIVLGNTEKVVVVNPTAVSNDEKQSIITAFMNKNQNIRGYLASTDPVTVDNNGNVTLHYRDGSSTTLDATNVMTYEPVVKPEYQTVNAAKTATVTIAKGQSFSIGDIKQYFTLSNGQPIPSGTFTNITSDRTIPTAQEVSQMNAGTQLYHITATNAYHKDSEDFYISLKIIDVKQPEGDQRVYRTSTYDLTTDEISKVKQAFINANRDVITLAEGDISVTNTPNGANVSTITVNINKGRLTKSFASNLANMNFLRWVNFPQDYTVTWTNAKIANRPTDGGLSWSDDHKSLIYRYDATLGTQITTNDILTMLKATTTVPGLRNNITGNEKSQAEAGGRPNFRTTGYSQSNATTDGQRQFTLNGQVIQVLDIINPSNGYGGQPVTNSNTRANHSNSTVVNVNEPAANGAGAFTIDHVVKSNSTHNASDAVYKAQLYLTPYGPKQYVEHLNQNTGNTTDAINIYFVPSDLVNPTISVGNYTNHQVFSGETFTNTITANDNFGVQSVTVPNTSQITGTVDNNHQHVSATAPNVTSATNKTINLLATDTSGNTATTSFNVTVKPLRDKYRVGTSSTAANPVRIANISNNATVSQADQTTIINSLTFTETVPNRSYARASANEITSKTVSNVSRTGNNANVTVTVTYQDGTTSTVTVPVKHVIPEIVAHSHYTVQGQDFPAGNGSSASDYFKLSNGSDIADATITWVSGQAPNKDNTRIGEDITVTAHILIDGETTPITKTATYKVVRTVPKHVFETARGVLYPGVSDMYDAKQYVKPVNNSWSTNAQHMNFQFVGTYGPNKDVVGISTRLIRVTYDNRQTEDLTILSKVKPDPPRIDANSVTYKAGLTNQEIKVNNVLNNSSVKLFKADNTPLNVTNITHGSGFSSVVTVSDALPNGGIKAKSSISMNNVTYTTQDEHGQVVTVTRNESVDSNDSATVTVTPQLQATTEGAVFIKGGDGFDFGHVERFIQNPPHGATVAWHDSPDTWKNTVGNTHKTAVVTLPNGQGTRNVEVPVKVYPVANAKAPSRDVKGQNLTNGTDAMNYITFDPNTNTNGITAAWANRQQPNNQQAGVQHLNVDVTYPGISAAKRVPVTVNVYQFEFPQTTYTTTVGGTLASGTQASGYAHMQNATGLPTDGFTYKWNRDTTGTNDANWSAMNKPNVAKVVNAKYDVIYNGHTFATSLPAKFVVKDVQPAKPTVTETAAGAITIAPGANQTVNTHAGNVTTYADKLVIKRNGNVVTTFTRRNNTSPWVKEASAATVAGIAGTNNGITVAAGTFNPADTIQVVATQGSGETVSDEQRSDDFTVVAPQPNQATTKIWQNGHIDITPNNPSGHLINPTQAMDIAYTEKVGNGAEHSKTINVVRGQNNQWTIANKPDYVTLDAQTGKVTFNANTIKPNSSITITPKAGTGHSVSSNPSTLTAPAAHTVNTTEIVKDYGSNVTAAEINNAVQVANKRTATIKNGTAMPTNLAGGSTTTIPVTVTYNDGSTEEVQESIFTKADKRELITAKNHLDDPVSTEGKKPGTITQYNNAMHNAQQQINTAKTEAQQVINNERATPQQVSDALTKVRAAQTKIDQAKALLQNKEDNSQLVTSKNNLQSSVNQVPSTAGMTQQSIDNYNAKKREAETEITAAQRVIDNGDATAQQISDEKHRVDNALTALNQAKHDLTADTHALEQAVQQLNRTGTTTGKKPASITAYNNSIRALQSDLTSAKNSANAIIQKPIRTVQEVQSALTNVNRVNERLTQAINQLVPLADNSALKTAKTKLDEEINKSVTTDGMTQSSIQAYENAKRAGQTESTNAQNVINNGDATDQQIAAEKTKVEEKYNSLKQAIAGLTPDLAPLQTAKTQLQNDIDQPTSTTGMTSASIAAFNEKLSAARTKIQEIDRVLASHPDVATIRQNVTAANAAKSALDQARNGLTVDKAPLENAKNQLQYSIDTQTSTTGMTQDSINAYNAKLTAARNKIQQINQVLAGSPTVEQINTNTSTANQAKSDLDHARQALTPDKAPLQTAKTQLEQSINQPTDTTGMTTASLNAYNQKLQAARQKLTEINQVLNGNPTVQNINDKVTEANQAKDQLNTARQGLTLDRQPALTTLHGASNLNQAQQNNFTQQINAAQNHAALETIKSNITALNTAMTKLKDSVADNNTIKSDQNYTDATPANKQAYDNAVNAAKGVIGETTNPTMDVNTVNQKAASVKSTKDALDGQQNLQRAKTEATNAITHASDLNQAQKNALTQQVNSAQNVQAVNDIKQTTQSLNTAMTGLKRGVANHNQVVQSDNYVNADTNKKNDYNNAYNHANDIINGNAQHPVITPSDVNNALSNVTSKEHALNGEAKLNAAKQEANTALGHLNNLNNAQRQNLQSQINGAHQIDAVNTIKQNATNLNSAMGNLRQAVADKDQVKRTEDYADADTAKQNAYNSAVSSAETIINQTTNPTMSVDDVNRATSAVTSNKNALNGYEKLAQSKTDAARAIDALPHLNNAQKADVKSKINAASNIAGVNTVKQQGTDLNTAMGNLQGAINDEQTTLNSQNYQDATPSKKTAYTNAVQAAKDILNKSNGQNKTKDQVTEAMNQVNSAKNNLDGTRLLDQAKQTAKQQLNNMTHLTTAQKTNLTNQINSGTTVAGVQTVQSNANTLDQAMNTLRQSIANKDATKASEDYVDANNDKQTAYNNAVAAAETIINANSNPEMNPSTITQKAEQVNSSKTALNGDENLAAAKQNAKTYLNTLTSITDAQKNNLISQITSATRVSGVDTVKQNAQHLDQAMASLQNGINNESQVKSSEKYRDADTNKQQEYDNAITAAKAILNKSTGPNTAQNAVEAALQRVNNAKDALNGDAKLIAAQNAAKQHLGTLTHITTAQRNDLTNQISQATNLAGVESVKQNANSLDGAMGNLQTAINDKSGTLASQNFLDADEQKRNAYNQAVSAAETILNKQTGPNTAKTAVEQALNNVNNAKHALNGTQNLNNAKQAAITAINGASDLNQKQKDALKAQANGAQRVSNAQDVQHNATELNTAMGTLKHAIADKTNTLASSKYVNADSTKQNAYTTKVTNAEHIISGTPTVVTTPSEVTAAANQVNSAKQELNGDERLREAKQNANTAIDALTQLNTPQKAKLKEQVGQANRLEDVQTVQTNGQALNNAMKGLRDSIANETTVKTSQNYTDASPNNQSTYNSAVSNAKGIINQTNNPTMDTSAITQATTQVNNAKNGLNGAENLRNAQNTAKQNLNTLSHLTNNQKSAISSQIDRAGHVSEVTATKNAATELNTQMGNLEQAIHDQNTVKQSVKFTDADKAKRDAYTNAVSRAEAILNKTQGANTSKQDVEAAIQNVSSAKNALNGDQNVTNAKNAAKNALNNLTSINNAQKRDLTTKIDQATTVAGVEAVSNTSTQLNTAMANLQNGINDKTNTLASENYHDADSDKKTAYTQAVTNAENILNKNSGSNLDKTAVENALSQVANAKGALNGNHNLEQAKSNANTTINGLQHLTTAQKDKLKQQVQQAQNVAGVDTVKSSANTLNGAMGTLRNSIQDNTATKNGQNYLDATERNKTNYNNAVDSANGVINATSNPNMDANAINQIATQVTSTKNALDGTHNLTQAKQTATNAIDGATNLNKAQKDALKAQVTSAQRVANVTSIQQTANELNTAMGQLQHGIDDENATKQTQKYRDAEQSKKTAYDQAVAAAKAILNKQTGSNSDKAAVDRALQQVTSTKDALNGDAKLAEAKAAAKQNLGTLNHITNAQRTDLEGQNNQATTVDGVNTVKTNANTLDGAMNSLQGSINDKDATLRNQNYLDADESKRNAYTQAVTAAEGILNKQTGGNTSKADVDNALNAVTRAKAALNGADNLRNAKTSATNTIDGLPNLTQLQKDNLKHQVEQAQNVAGVNGVKDKGNTLNTAMGALRTSIQNDNTTKTSQNYLDASDSNKNNYNTAVNNANGVINATNNPNMDANAINGMANQVNTTKAALNGAQNLAQAKTN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ELSVVKQQAIESIENAAQQKINEINNSVTLTLEQKEAAIAEVNKLKQQAIDHVNNAPDVHSVEEIQQQEQAHIEQFNPEQFTIEQAKSNAIKSIEDAIQHMIDEIKARTDLTDKEKQEAIAKLNQLKEQAIQAIQRAQSIDEISEQLEQFKAQMKAANPTAKELAKRKQEAISRIKDFSNEKINSIRNSEIGTADEKQAAMNQINEIVLETIRDINNAHTLQQVEAALNNGIARISAVQIVTSDRAKQSSSTGNESNSHLTIGYGTANHPFNSSTIGHKKKLDEDDDIDPLHMRHFSNNFGNVIKNAIGVVGISGLLASFWFFIAKRRRKEDEEEELEIRDNNKDSIKETLDDTKHLPLLFAKRRRKEDEEDVTVEEKDSLNNGESLDKVKHTPFFLPKRRRKEDEEDVEVTNENTDEKVLKDNEHSPLLFAKRRKDKEEDVETTTSIESKDEDVPLLLAKKKNQKDNQSKDKKSASKNTSKKVAAKKKKKKAKKNKK

Experimental data[edit | edit source]

  • experimentally validated: see SACOL1472
  • protein localization: see SACOL1472
  • quantitative data / protein copy number per cell:
  • interaction partners:

Expression & Regulation[edit | edit source]

Operon[edit | edit source]

Regulation[edit | edit source]

  • regulator:

Transcription pattern[edit | edit source]

Protein synthesis (provided by Aureolib)[edit | edit source]

Protein stability[edit | edit source]

  • half-life: no data available

Biological Material[edit | edit source]

Mutants[edit | edit source]

Expression vector[edit | edit source]

lacZ fusion[edit | edit source]

GFP fusion[edit | edit source]

two-hybrid system[edit | edit source]

FLAG-tag construct[edit | edit source]

Antibody[edit | edit source]

Other Information[edit | edit source]

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Literature[edit | edit source]

References[edit | edit source]

Relevant publications[edit | edit source]